16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2256 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2256  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  565  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1769  hypothetical protein  48.58 
 
 
285 aa  285  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23774  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2917  hypothetical protein  47.87 
 
 
289 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.811586  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20060  hypothetical protein  29.08 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0343  hypothetical protein  36.13 
 
 
277 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0321  hypothetical protein  36.33 
 
 
277 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0332  hypothetical protein  35.66 
 
 
277 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4243  hypothetical protein  34.06 
 
 
281 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2896  hypothetical protein  29.82 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0596  hypothetical protein  29.67 
 
 
373 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47166  predicted protein  32.43 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0922  hypothetical protein  28.43 
 
 
287 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0285  hypothetical protein  22.47 
 
 
286 aa  60.1  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2334  hypothetical protein  22.42 
 
 
288 aa  58.9  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0941  hypothetical protein  26.64 
 
 
283 aa  53.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.788557 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4966  hypothetical protein  23.56 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.276697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>