21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6472 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007337  Reut_D6472  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
235 aa  470  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07760  dienelactone hydrolase-like enzyme  30 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  26.9 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10371  dienelactone hydrolase  28.42 
 
 
246 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  25.53 
 
 
234 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  26.21 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2726  dienelactone hydrolase  25 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401579  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  24.24 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  26.56 
 
 
261 aa  45.4  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  26.18 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  29.53 
 
 
415 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0084  carboxymethylenebutenolidase  26.92 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  30.73 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  25.63 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  25.84 
 
 
433 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  29.32 
 
 
409 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  28.19 
 
 
407 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  24.59 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  29.32 
 
 
409 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1497  dienelactone hydrolase  20.28 
 
 
238 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.184657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>