24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_R0011 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_R0011  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.619648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0013  tRNA-Asp  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0414  tRNA-Asp  86.36 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0616515  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0173  tRNA-Asp  86.36 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0024  tRNA-Asp  86.36 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00556712  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0034  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0915271  hitchhiker  0.000000414345 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0063  tRNA-Asp  89.58 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  84.85 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0102233  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  84.85 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  84.85 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0003  tRNA-Asp  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.541849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0058  tRNA-Asp  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0024  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0025  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0013  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0014  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0050  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0024  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 97 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0040  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0030  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00775153  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0031  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.998117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0016  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0017  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 98 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>