30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_R0005 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119757  normal  0.77119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0007  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476164 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0034  tRNA-Gly  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000457466  normal  0.978086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0049  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000210611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0004  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0059  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000205536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0057  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0056  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.661302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0067  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.38974  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0062  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0043  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0944227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  90.7 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0053  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571258  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14033  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000415175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna5  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627053  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0045  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14870  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0036  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0053  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6029  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.065223  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0045  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.34247  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0015  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0026  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.768519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0019  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0015  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0016  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0855316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0053  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000611222  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0033  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.170039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>