19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_R0036 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_R0036  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14870  tRNA-Cys  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0045  tRNA-Cys  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0027  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.258268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0036  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601784  normal  0.0254396 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0040  tRNA-Cys  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.29176  normal  0.285834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0016  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0855316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14033  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000415175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0045  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.34247  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0015  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0019  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0015  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0022  tRNA-Cys  90.28 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0037  tRNA-Cys  89.83 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0501912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0020  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0031  tRNA-Cys  86.15 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.931849  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0038  tRNA-Cys  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0007  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119757  normal  0.77119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>