30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0938 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0938  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.156043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4281  hypothetical protein  79.65 
 
 
172 aa  289  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0720586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0264  hypothetical protein  45.75 
 
 
175 aa  124  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  26.11 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  25.5 
 
 
187 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  26.39 
 
 
200 aa  48.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  27.19 
 
 
153 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  26.15 
 
 
187 aa  47.8  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  28 
 
 
205 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3948  hypothetical protein  34.62 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0198383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  26.8 
 
 
191 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  30.88 
 
 
251 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  28.67 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  22.7 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  23.74 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  24 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  25.17 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  24.32 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  26.4 
 
 
203 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  22.82 
 
 
187 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  27.82 
 
 
192 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  25.98 
 
 
189 aa  42  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  26.56 
 
 
218 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  28.83 
 
 
203 aa  42  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0255  protein of unknown function DUF820  30.16 
 
 
165 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  27.05 
 
 
202 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2041  hypothetical protein  32.18 
 
 
186 aa  41.2  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3293  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
222 aa  40.8  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00444242  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  25.81 
 
 
187 aa  40.8  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>