28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2005 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1836  hypothetical protein  92.8 
 
 		 403 aa  780    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.367512 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2005  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  819    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2494  hypothetical protein  76.92 
 
 		 400 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2333  hypothetical protein  78.91 
 
 		 400 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.890086  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2160  hypothetical protein  93.05 
 
 		 403 aa  780    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1095  hypothetical protein  52.84 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000793055  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3175  hypothetical protein  51.98 
 
 		 404 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000682479  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1974  hypothetical protein  52.72 
 
 		 404 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00146701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1606  hypothetical protein  53.33 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000123476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2218  hypothetical protein  53.33 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000136646  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1059  hypothetical protein  53.33 
 
 		 405 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000039048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1380  hypothetical protein  51.98 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0101715  decreased coverage  0.000593666 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5546  hypothetical protein  52.59 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000895674  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2256  hypothetical protein  52.96 
 
 		 432 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000412599  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2242  hypothetical protein  53.33 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2135  hypothetical protein  52.59 
 
 		 405 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000112309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1067  hypothetical protein  49.01 
 
 		 403 aa  419  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.540517  normal  0.0490295 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0703  hypothetical protein  52.35 
 
 		 405 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000398804  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0754  hypothetical protein  47.77 
 
 		 403 aa  418  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0449  hypothetical protein  52.35 
 
 		 405 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000172136  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1335  hypothetical protein  52.35 
 
 		 405 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00695145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1326  hypothetical protein  52.35 
 
 		 405 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000393653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1166  hypothetical protein  52.35 
 
 		 405 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112844  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1472  hypothetical protein  52.35 
 
 		 405 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000930484  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1794  hypothetical protein  52.35 
 
 		 405 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000117131  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2657  hypothetical protein  42.25 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00813154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2894  hypothetical protein  38.37 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2109  hypothetical protein  37.02 
 
 		 404 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.657946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>