28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1067 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0754  hypothetical protein  89.58 
 
 		 403 aa  753    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1067  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  823    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.540517  normal  0.0490295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2494  hypothetical protein  52.23 
 
 		 400 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1836  hypothetical protein  49.5 
 
 		 403 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.367512 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2333  hypothetical protein  51.24 
 
 		 400 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.890086  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2160  hypothetical protein  49.75 
 
 		 403 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2005  hypothetical protein  49.01 
 
 		 403 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1095  hypothetical protein  44.55 
 
 		 405 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000793055  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3175  hypothetical protein  45.16 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000682479  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1380  hypothetical protein  44.91 
 
 		 404 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0101715  decreased coverage  0.000593666 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5546  hypothetical protein  46.91 
 
 		 405 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000895674  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2135  hypothetical protein  45.05 
 
 		 405 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000112309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1606  hypothetical protein  46.42 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000123476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2218  hypothetical protein  46.42 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000136646  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2242  hypothetical protein  46.42 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1059  hypothetical protein  45.68 
 
 		 405 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000039048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0703  hypothetical protein  44.55 
 
 		 405 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000398804  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0449  hypothetical protein  44.55 
 
 		 405 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000172136  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1335  hypothetical protein  44.55 
 
 		 405 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00695145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1326  hypothetical protein  44.55 
 
 		 405 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000393653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1166  hypothetical protein  44.55 
 
 		 405 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112844  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1472  hypothetical protein  44.55 
 
 		 405 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000930484  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1794  hypothetical protein  44.55 
 
 		 405 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000117131  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2256  hypothetical protein  45.05 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000412599  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1974  hypothetical protein  43.92 
 
 		 404 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00146701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2894  hypothetical protein  37.4 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2657  hypothetical protein  36 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00813154  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2109  hypothetical protein  33.91 
 
 		 404 aa  243  6e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.657946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>