28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1380 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1794  hypothetical protein  85.19 
 
 
405 aa  695    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000117131  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1380  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  825    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0101715  decreased coverage  0.000593666 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1974  hypothetical protein  90.84 
 
 
404 aa  737    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00146701  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2135  hypothetical protein  84.94 
 
 
405 aa  694    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000112309  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2242  hypothetical protein  84.94 
 
 
405 aa  690    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156663  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1059  hypothetical protein  85.93 
 
 
405 aa  701    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000039048  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0449  hypothetical protein  85.19 
 
 
405 aa  695    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000172136  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1335  hypothetical protein  85.19 
 
 
405 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00695145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1326  hypothetical protein  85.19 
 
 
405 aa  695    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000393653  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0703  hypothetical protein  85.19 
 
 
405 aa  695    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000398804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1166  hypothetical protein  85.19 
 
 
405 aa  695    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2218  hypothetical protein  84.94 
 
 
405 aa  691    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000136646  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2256  hypothetical protein  84.2 
 
 
432 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000412599  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1606  hypothetical protein  84.94 
 
 
405 aa  691    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000123476  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3175  hypothetical protein  98.27 
 
 
404 aa  813    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000682479  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1095  hypothetical protein  85.19 
 
 
405 aa  714    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000793055  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5546  hypothetical protein  84.94 
 
 
405 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000895674  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1472  hypothetical protein  85.19 
 
 
405 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000930484  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2333  hypothetical protein  55.45 
 
 
400 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.890086  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2494  hypothetical protein  53.96 
 
 
400 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2005  hypothetical protein  51.98 
 
 
403 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2160  hypothetical protein  51.73 
 
 
403 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1836  hypothetical protein  51.98 
 
 
403 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.367512 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0754  hypothetical protein  45.16 
 
 
403 aa  368  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1067  hypothetical protein  44.91 
 
 
403 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.540517  normal  0.0490295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2657  hypothetical protein  42.79 
 
 
389 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00813154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2894  hypothetical protein  38.23 
 
 
390 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2109  hypothetical protein  38.75 
 
 
404 aa  273  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.657946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>