28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2135 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1794  hypothetical protein  88.89 
 
 		 405 aa  738    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000117131  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1380  hypothetical protein  84.94 
 
 		 404 aa  696    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0101715  decreased coverage  0.000593666 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1974  hypothetical protein  83.7 
 
 		 404 aa  691    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00146701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2135  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  828    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000112309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2242  hypothetical protein  96.79 
 
 		 405 aa  785    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1059  hypothetical protein  95.56 
 
 		 405 aa  780    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000039048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0449  hypothetical protein  88.89 
 
 		 405 aa  738    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000172136  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1335  hypothetical protein  88.89 
 
 		 405 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00695145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1326  hypothetical protein  88.89 
 
 		 405 aa  738    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000393653  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0703  hypothetical protein  88.89 
 
 		 405 aa  738    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000398804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1166  hypothetical protein  88.89 
 
 		 405 aa  738    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2218  hypothetical protein  96.54 
 
 		 405 aa  783    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000136646  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2256  hypothetical protein  99.26 
 
 		 432 aa  823    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000412599  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1606  hypothetical protein  96.54 
 
 		 405 aa  783    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000123476  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3175  hypothetical protein  83.95 
 
 		 404 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000682479  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1095  hypothetical protein  88.64 
 
 		 405 aa  756    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000793055  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5546  hypothetical protein  96.3 
 
 		 405 aa  781    Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000895674  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1472  hypothetical protein  88.89 
 
 		 405 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000930484  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2333  hypothetical protein  55.31 
 
 		 400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.890086  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2494  hypothetical protein  54.93 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2005  hypothetical protein  52.59 
 
 		 403 aa  433  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2160  hypothetical protein  52.1 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1836  hypothetical protein  52.1 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.367512 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0754  hypothetical protein  45.79 
 
 		 403 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1067  hypothetical protein  45.05 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.540517  normal  0.0490295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2657  hypothetical protein  42.93 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00813154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2894  hypothetical protein  39.85 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2109  hypothetical protein  38.9 
 
 		 404 aa  277  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.657946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>