59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0526 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0526  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  290  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2178  hypothetical protein  97.9 
 
 
143 aa  283  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0585707  normal  0.0571233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1261  hypothetical protein  85.31 
 
 
143 aa  249  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112296  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3158  hypothetical protein  61.87 
 
 
149 aa  168  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.288406  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2803  hypothetical protein  58.7 
 
 
147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1134  hypothetical protein  54.61 
 
 
141 aa  150  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2772  hypothetical protein  56.83 
 
 
142 aa  150  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.291396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2816  hypothetical protein  56.83 
 
 
142 aa  150  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.619109  normal  0.0298901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2799  hypothetical protein  56.83 
 
 
169 aa  149  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0692616  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11901  hypothetical protein  55 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.981624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2662  Protein of unknown function DUF1810  52.59 
 
 
141 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3967  hypothetical protein  51.8 
 
 
139 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1802  hypothetical protein  54.68 
 
 
141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.544054 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6461  hypothetical protein  54.81 
 
 
147 aa  143  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.595858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3733  hypothetical protein  53.57 
 
 
156 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1988  hypothetical protein  52.9 
 
 
140 aa  141  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4679  hypothetical protein  54.96 
 
 
133 aa  140  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.856703  normal  0.978928 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2042  Protein of unknown function DUF1810  53.03 
 
 
141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0742  hypothetical protein  54.48 
 
 
144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0671358  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3060  hypothetical protein  55 
 
 
142 aa  138  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.303611 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2637  hypothetical protein  52.9 
 
 
140 aa  138  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649202  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2875  hypothetical protein  55 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3610  hypothetical protein  55.4 
 
 
142 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136952  hitchhiker  0.00193828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3017  Protein of unknown function DUF1810  51.11 
 
 
144 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4865  hypothetical protein  53.68 
 
 
148 aa  135  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2294  hypothetical protein  49.64 
 
 
141 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.518466  decreased coverage  0.0000274464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4303  hypothetical protein  51.77 
 
 
144 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0957132  normal  0.0245266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3322  hypothetical protein  53.57 
 
 
142 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2762  Protein of unknown function DUF1810  44.93 
 
 
144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2659  Protein of unknown function DUF1810  48.92 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0725  Protein of unknown function DUF1810  51.82 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2192  hypothetical protein  49.64 
 
 
139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0454304  hitchhiker  0.00267672 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5794  Protein of unknown function DUF1810  49.64 
 
 
143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00427716 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6697  Protein of unknown function DUF1810  48.92 
 
 
146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0685  Protein of unknown function DUF1810  50.37 
 
 
142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3799  Protein of unknown function DUF1810  51.85 
 
 
140 aa  127  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3592  Protein of unknown function DUF1810  50.35 
 
 
143 aa  127  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232869  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0712  hypothetical protein  51.09 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.482745  normal  0.169114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4003  Protein of unknown function DUF1810  44.68 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00000000000470878 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2331  hypothetical protein  47.76 
 
 
142 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3405  Protein of unknown function DUF1810  50 
 
 
145 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000170541  hitchhiker  0.0000273643 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2066  hypothetical protein  48.59 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0189706  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4946  hypothetical protein  47.18 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38598  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2060  Protein of unknown function DUF1810  47.14 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000959142 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3328  hypothetical protein  41.84 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50804  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4801  Protein of unknown function DUF1810  47.14 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328376  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0090  hypothetical protein  48.59 
 
 
143 aa  114  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3565  hypothetical protein  39.71 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3705  hypothetical protein  41.3 
 
 
153 aa  113  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1379  hypothetical protein  43.51 
 
 
146 aa  113  8.999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0618407  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1962  hypothetical protein  41.67 
 
 
177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0306163  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0613  Protein of unknown function DUF1810  42.86 
 
 
168 aa  110  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3334  hypothetical protein  53.1 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0501605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4656  hypothetical protein  40.31 
 
 
149 aa  107  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0152  ADP-ribose pyrophosphatase with uncharacterized conserved domain  40.14 
 
 
312 aa  100  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2882  hypothetical protein  48.54 
 
 
153 aa  99  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4382  hypothetical protein  40.57 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0674  hypothetical protein  42.61 
 
 
317 aa  88.2  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0657  hypothetical protein  41.74 
 
 
317 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>