59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3705 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3705  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  315  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2659  Protein of unknown function DUF1810  53.62 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.132721 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4946  hypothetical protein  57.58 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0613  Protein of unknown function DUF1810  54.41 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4801  Protein of unknown function DUF1810  53.19 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3610  hypothetical protein  53.24 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136952  hitchhiker  0.00193828 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2066  hypothetical protein  52.52 
 
 		 142 aa  151  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0189706  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0685  Protein of unknown function DUF1810  52.55 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0725  Protein of unknown function DUF1810  51.8 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3967  hypothetical protein  52.55 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6461  hypothetical protein  52.14 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.595858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2662  Protein of unknown function DUF1810  51.82 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3405  Protein of unknown function DUF1810  50.71 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000170541  hitchhiker  0.0000273643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4003  Protein of unknown function DUF1810  46.67 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00000000000470878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3017  Protein of unknown function DUF1810  47.86 
 
 		 144 aa  147  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0712  hypothetical protein  51.08 
 
 		 143 aa  147  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.482745  normal  0.169114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2803  hypothetical protein  50.7 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1134  hypothetical protein  53.28 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3322  hypothetical protein  51.43 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2192  hypothetical protein  51.09 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0454304  hitchhiker  0.00267672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4303  hypothetical protein  50.7 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0957132  normal  0.0245266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4679  hypothetical protein  54.26 
 
 		 133 aa  143  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.856703  normal  0.978928 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5794  Protein of unknown function DUF1810  48.15 
 
 		 143 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00427716 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3565  hypothetical protein  44.93 
 
 		 139 aa  140  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1988  hypothetical protein  49.28 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3733  hypothetical protein  45.27 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11901  hypothetical protein  48.2 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.981624 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2060  Protein of unknown function DUF1810  49.31 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000959142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2637  hypothetical protein  47.45 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3799  Protein of unknown function DUF1810  48.55 
 
 		 140 aa  137  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4865  hypothetical protein  45.93 
 
 		 148 aa  136  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0742  hypothetical protein  48.87 
 
 		 144 aa  135  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0671358  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3060  hypothetical protein  48.91 
 
 		 142 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303611 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6697  Protein of unknown function DUF1810  45.99 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44391 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2294  hypothetical protein  44.93 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.518466  decreased coverage  0.0000274464 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2762  Protein of unknown function DUF1810  45.32 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3592  Protein of unknown function DUF1810  47.45 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232869  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1802  hypothetical protein  46.72 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.544054 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2042  Protein of unknown function DUF1810  45.99 
 
 		 141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2799  hypothetical protein  45.26 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0692616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2816  hypothetical protein  45.26 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.619109  normal  0.0298901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2772  hypothetical protein  45.26 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.291396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3328  hypothetical protein  44.36 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50804  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1962  hypothetical protein  46.15 
 
 		 177 aa  128  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0306163  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0090  hypothetical protein  47.41 
 
 		 143 aa  126  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2875  hypothetical protein  46.76 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1261  hypothetical protein  44.93 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2331  hypothetical protein  44.03 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3158  hypothetical protein  44.29 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.288406  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2178  hypothetical protein  42.75 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0585707  normal  0.0571233 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1379  hypothetical protein  41.55 
 
 		 146 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0618407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4656  hypothetical protein  41.48 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0152  ADP-ribose pyrophosphatase with uncharacterized conserved domain  41.01 
 
 		 312 aa  116  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0526  hypothetical protein  41.3 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3334  hypothetical protein  49.11 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501605 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2882  hypothetical protein  40.16 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4382  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0674  hypothetical protein  40.74 
 
 		 317 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0657  hypothetical protein  40.74 
 
 		 317 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>