59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2882 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2882  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  314  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6697  Protein of unknown function DUF1810  47.66 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44391 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5794  Protein of unknown function DUF1810  46.88 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00427716 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0725  Protein of unknown function DUF1810  48.09 
 
 		 143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3405  Protein of unknown function DUF1810  49.24 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000170541  hitchhiker  0.0000273643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4656  hypothetical protein  43.8 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0712  hypothetical protein  47.33 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.482745  normal  0.169114 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4865  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4003  Protein of unknown function DUF1810  45.11 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00000000000470878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4801  Protein of unknown function DUF1810  49.21 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3610  hypothetical protein  46.67 
 
 		 142 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136952  hitchhiker  0.00193828 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3060  hypothetical protein  47.58 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0685  Protein of unknown function DUF1810  44.27 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2066  hypothetical protein  46.97 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0189706  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2772  hypothetical protein  44.78 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.291396  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2331  hypothetical protein  41.41 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2816  hypothetical protein  44.78 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.619109  normal  0.0298901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2799  hypothetical protein  44.78 
 
 		 169 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0692616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2662  Protein of unknown function DUF1810  45.04 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1962  hypothetical protein  40.91 
 
 		 177 aa  117  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0306163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3799  Protein of unknown function DUF1810  48.39 
 
 		 140 aa  117  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3565  hypothetical protein  41.13 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2042  Protein of unknown function DUF1810  45.86 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4303  hypothetical protein  49.07 
 
 		 144 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0957132  normal  0.0245266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1988  hypothetical protein  48.76 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2192  hypothetical protein  42.54 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0454304  hitchhiker  0.00267672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1134  hypothetical protein  44.53 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2637  hypothetical protein  47.2 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0742  hypothetical protein  45.04 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0671358  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3705  hypothetical protein  40.46 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2803  hypothetical protein  50.96 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.592382 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4946  hypothetical protein  42.22 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2060  Protein of unknown function DUF1810  44.27 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000959142 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6461  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.595858 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2294  hypothetical protein  43.55 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.518466  decreased coverage  0.0000274464 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1802  hypothetical protein  45.6 
 
 		 141 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.544054 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2762  Protein of unknown function DUF1810  40.91 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3017  Protein of unknown function DUF1810  42.74 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11901  hypothetical protein  45.97 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.981624 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1261  hypothetical protein  42.42 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3592  Protein of unknown function DUF1810  45.6 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232869  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2659  Protein of unknown function DUF1810  45.6 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.132721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3322  hypothetical protein  42.42 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1379  hypothetical protein  40.32 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0618407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2875  hypothetical protein  42.96 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2178  hypothetical protein  47.32 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0585707  normal  0.0571233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4679  hypothetical protein  40.77 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.856703  normal  0.978928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0526  hypothetical protein  47.32 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3733  hypothetical protein  41.61 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0090  hypothetical protein  39.26 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3158  hypothetical protein  41.3 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.288406  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3967  hypothetical protein  42.62 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3328  hypothetical protein  34.92 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50804  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0613  Protein of unknown function DUF1810  37.31 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0152  ADP-ribose pyrophosphatase with uncharacterized conserved domain  36.09 
 
 		 312 aa  98.6  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3334  hypothetical protein  44.83 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4382  hypothetical protein  43.16 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0674  hypothetical protein  37.07 
 
 		 317 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0657  hypothetical protein  38.05 
 
 		 317 aa  81.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>