17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03699 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS03699  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532956  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0120  hypothetical protein  34.95 
 
 
313 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2737  hypothetical protein  36.06 
 
 
262 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0444966  normal  0.0153273 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1548  hypothetical protein  37.25 
 
 
301 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1567  hypothetical protein  36.84 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335992  normal  0.17582 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0283  hypothetical protein  33.2 
 
 
290 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0495  hypothetical protein  32.1 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1647  hypothetical protein  33.45 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1591  hypothetical protein  35.09 
 
 
310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.196287  normal  0.0406623 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1622  hypothetical protein  36 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407724 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4795  hypothetical protein  35.71 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124929  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1829  hypothetical protein  32.05 
 
 
256 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1167  hypothetical protein  33.2 
 
 
250 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0007  hypothetical protein  26.27 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10854  hypothetical protein  29.74 
 
 
248 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.52115e-35  decreased coverage  0.00000000784145 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04230  hypothetical protein  26.73 
 
 
230 aa  52  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23030  hypothetical protein  25.11 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.340517  normal  0.0165029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>