19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0495 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0495  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0283  hypothetical protein  32.48 
 
 
290 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2737  hypothetical protein  37.44 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0444966  normal  0.0153273 
 
 
-
 
NC_003296  RS03699  hypothetical protein  32.1 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532956  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1567  hypothetical protein  36.8 
 
 
301 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335992  normal  0.17582 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1548  hypothetical protein  36.4 
 
 
301 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268009  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0120  hypothetical protein  33.47 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1622  hypothetical protein  35.94 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407724 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1647  hypothetical protein  34.8 
 
 
301 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1829  hypothetical protein  30.8 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4795  hypothetical protein  33.98 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124929  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1591  hypothetical protein  33.59 
 
 
310 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.196287  normal  0.0406623 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1167  hypothetical protein  35.71 
 
 
250 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10854  hypothetical protein  34.95 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.52115e-35  decreased coverage  0.00000000784145 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23030  hypothetical protein  32.21 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.340517  normal  0.0165029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0007  hypothetical protein  25.39 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04230  hypothetical protein  31.03 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0440  hypothetical protein  27.13 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1284  hypothetical protein  24.71 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.225256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>