17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1647 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1647  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1622  hypothetical protein  98.34 
 
 
301 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407724 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1567  hypothetical protein  88.7 
 
 
301 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335992  normal  0.17582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1167  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1548  hypothetical protein  88.04 
 
 
301 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268009  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4795  hypothetical protein  86.35 
 
 
301 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124929  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1591  hypothetical protein  80.61 
 
 
310 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.196287  normal  0.0406623 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0120  hypothetical protein  56.25 
 
 
313 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0495  hypothetical protein  34.8 
 
 
284 aa  142  8e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03699  hypothetical protein  33.45 
 
 
287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532956  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2737  hypothetical protein  34.07 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0444966  normal  0.0153273 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0283  hypothetical protein  30.22 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1829  hypothetical protein  29.11 
 
 
256 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0007  hypothetical protein  27.73 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10854  hypothetical protein  33.47 
 
 
248 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.52115e-35  decreased coverage  0.00000000784145 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23030  hypothetical protein  29.3 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.340517  normal  0.0165029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04230  hypothetical protein  30.85 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>