17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1548 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1548  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  597  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1567  hypothetical protein  97.34 
 
 
301 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335992  normal  0.17582 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1622  hypothetical protein  88.37 
 
 
301 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407724 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1647  hypothetical protein  88.04 
 
 
301 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4795  hypothetical protein  83.39 
 
 
301 aa  454  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124929  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1591  hypothetical protein  78.45 
 
 
310 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.196287  normal  0.0406623 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1167  hypothetical protein  88.8 
 
 
250 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0120  hypothetical protein  55.93 
 
 
313 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03699  hypothetical protein  36.82 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532956  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0495  hypothetical protein  36.4 
 
 
284 aa  139  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2737  hypothetical protein  35.14 
 
 
262 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0444966  normal  0.0153273 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0283  hypothetical protein  29.88 
 
 
290 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1829  hypothetical protein  28.39 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0007  hypothetical protein  27.35 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10854  hypothetical protein  30.84 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.52115e-35  decreased coverage  0.00000000784145 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23030  hypothetical protein  29.78 
 
 
241 aa  68.9  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.340517  normal  0.0165029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04230  hypothetical protein  30.43 
 
 
230 aa  49.3  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>