14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3998 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3998  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4837  hypothetical protein  96.91 
 
 		 97 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4158  hypothetical protein  92.78 
 
 		 97 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298906  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1418  hypothetical protein  88.66 
 
 		 97 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.806116  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3100  hypothetical protein  79.57 
 
 		 97 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2509  hypothetical protein  73.2 
 
 		 98 aa  142  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.386103  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1770  hypothetical protein  77.01 
 
 		 90 aa  141  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0041  hypothetical protein  32.22 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03344  hypothetical protein  32.22 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3324  hypothetical protein  31.87 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2370  hypothetical protein  26.88 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1108  hypothetical protein  31.87 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0664  hypothetical protein  30.38 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000106711  normal  0.0185111 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0118  hypothetical protein  29.21 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>