14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3324 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3324  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  173  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418635  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03344  hypothetical protein  69.14 
 
 		 81 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2370  hypothetical protein  43.33 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0118  hypothetical protein  51.25 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0496  hypothetical protein  34.12 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.366181 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3100  hypothetical protein  36.67 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2509  hypothetical protein  34.38 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.386103  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3998  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1418  hypothetical protein  31.87 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.806116  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4837  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4158  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298906  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1108  hypothetical protein  35.16 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2607  hypothetical protein  28.41 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>