13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2370 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2370  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  174  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3324  hypothetical protein  43.33 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418635  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03344  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0118  hypothetical protein  37.04 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2509  hypothetical protein  27.66 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.386103  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1418  hypothetical protein  27.96 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.806116  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3100  hypothetical protein  28.09 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4158  hypothetical protein  26.88 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298906  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4837  hypothetical protein  26.88 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3998  hypothetical protein  26.88 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0496  hypothetical protein  31.03 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.366181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1770  hypothetical protein  27.38 
 
 		 90 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1019  hypothetical protein  34.78 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.626186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>