12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0118 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0118  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  155  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0496  hypothetical protein  44.87 
 
 		 84 aa  76.6  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.366181 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03344  hypothetical protein  49.38 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3324  hypothetical protein  51.25 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2370  hypothetical protein  37.04 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1770  hypothetical protein  34.48 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2509  hypothetical protein  30 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.386103  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4158  hypothetical protein  33.71 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298906  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4837  hypothetical protein  31.46 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3100  hypothetical protein  29.21 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1418  hypothetical protein  25.84 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.806116  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3998  hypothetical protein  29.21 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>