12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03344 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03344  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3324  hypothetical protein  69.14 
 
 
86 aa  114  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418635  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0118  hypothetical protein  49.38 
 
 
78 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2370  hypothetical protein  40 
 
 
90 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0496  hypothetical protein  36.25 
 
 
84 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.366181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3998  hypothetical protein  32.22 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4837  hypothetical protein  32.22 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4158  hypothetical protein  32.22 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298906  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1418  hypothetical protein  32.58 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.806116  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1108  hypothetical protein  34.07 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3100  hypothetical protein  32.58 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2509  hypothetical protein  31.11 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.386103  normal  0.286576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>