16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2509 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2509  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  191  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.386103  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3100  hypothetical protein  92.63 
 
 
97 aa  174  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1418  hypothetical protein  74.23 
 
 
97 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.806116  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4837  hypothetical protein  73.2 
 
 
97 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3998  hypothetical protein  73.2 
 
 
97 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4158  hypothetical protein  73.2 
 
 
97 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298906  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1770  hypothetical protein  73.86 
 
 
90 aa  137  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2370  hypothetical protein  27.66 
 
 
90 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0041  hypothetical protein  33.71 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0664  hypothetical protein  32.91 
 
 
107 aa  47.8  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000106711  normal  0.0185111 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3324  hypothetical protein  31.91 
 
 
86 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418635  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0118  hypothetical protein  30 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03344  hypothetical protein  31.11 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0762  hypothetical protein  28.89 
 
 
103 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.613614  normal  0.418651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1108  hypothetical protein  31.18 
 
 
139 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0496  hypothetical protein  23.4 
 
 
84 aa  40.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.366181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>