18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1108 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1108  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  277  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1067  hypothetical protein  37.88 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11900  hypothetical protein  32.69 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00822143  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0664  hypothetical protein  41.49 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000106711  normal  0.0185111 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0762  hypothetical protein  38.1 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.613614  normal  0.418651 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2607  hypothetical protein  38.38 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1114  hypothetical protein  33.58 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1661  hypothetical protein  31.58 
 
 
202 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.241923 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1444  hypothetical protein  34.31 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000399173  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0688  hypothetical protein  29 
 
 
197 aa  52.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1771  hypothetical protein  31.91 
 
 
119 aa  52  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3100  hypothetical protein  32.58 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1418  hypothetical protein  32.98 
 
 
97 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.806116  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03344  hypothetical protein  34.07 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3998  hypothetical protein  31.87 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4837  hypothetical protein  31.87 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4158  hypothetical protein  31.87 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298906  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2509  hypothetical protein  31.52 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.386103  normal  0.286576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>