51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1123 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  100 
 
 		 141 aa  274  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  59.15 
 
 		 128 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  66.67 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3174  hypothetical protein  52.86 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798003  normal  0.0785982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0272  hypothetical protein  43.66 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5051  hypothetical protein  50.35 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2889  hypothetical protein  52.17 
 
 		 196 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00745568  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3884  BA14K family protein  35.42 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1780  BA14K family protein  34.64 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2716  BA14K family protein  60 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263756  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2493  BA14K family protein  60 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.279471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2421  BA14K family protein  63.64 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  42.5 
 
 		 235 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2082  hypothetical protein  77.42 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5379  BA14K family protein  75.76 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3033  hypothetical protein  85.71 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2417  hypothetical protein  45.45 
 
 		 223 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.0235404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0534  hypothetical protein  60.47 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0593  hypothetical protein  81.48 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2698  putative exported protein of unknown function  78.57 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0170396  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  36.08 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2214  BA14K family protein  31.06 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0671  BA14K family protein  31.17 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1569  hypothetical protein  51.11 
 
 		 211 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0550  BA14K family protein  41.89 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3014  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12196  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2373  hypothetical protein  64.29 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00903594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2438  hypothetical protein  55.88 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2464  hypothetical protein  63.64 
 
 		 230 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3358  BA14K family protein  47.37 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0598  BA14K family protein  40.54 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141665  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0553  hypothetical protein  32.34 
 
 		 253 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1649  hypothetical protein  29.13 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.989787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2136  hypothetical protein  72 
 
 		 210 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129106  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6139  hypothetical protein  29.45 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0587  hypothetical protein  31.52 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3811  hypothetical protein  52.63 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0228634  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0984  hypothetical protein  41.03 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2239  hypothetical protein  61.54 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3533  BA14K family protein  50 
 
 		 269 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100217  normal  0.403993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2744  hypothetical protein  65.38 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3004  BA14K family protein  65.38 
 
 		 150 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3404  hypothetical protein  43.75 
 
 		 244 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3651  BA14K family protein  29.07 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0987  hypothetical protein  42.86 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.283754  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1466  hypothetical protein  61.54 
 
 		 170 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1516  hypothetical protein  61.54 
 
 		 169 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5426  BA14K family protein  33.9 
 
 		 122 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2722  hypothetical protein  55.56 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.585488  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0688  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  34.29 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0735  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  34.29 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>