39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1942 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  54.23 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0272  hypothetical protein  48.06 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3174  hypothetical protein  48.85 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798003  normal  0.0785982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5051  hypothetical protein  77.5 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  80 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2889  hypothetical protein  47.83 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00745568  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3033  hypothetical protein  89.66 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2417  hypothetical protein  48.57 
 
 		 223 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.0235404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2716  BA14K family protein  56.36 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263756  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2493  BA14K family protein  56.36 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.279471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2421  BA14K family protein  56.36 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5379  BA14K family protein  47.93 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2082  hypothetical protein  80.65 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2698  putative exported protein of unknown function  82.76 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0170396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  75 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0593  hypothetical protein  81.48 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0534  hypothetical protein  77.42 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  35 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2464  hypothetical protein  63.64 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1569  hypothetical protein  57.14 
 
 		 211 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3811  hypothetical protein  33.61 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0228634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0685  hypothetical protein  69.23 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504453  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3014  hypothetical protein  45.95 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12196  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3358  BA14K family protein  62.96 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976069 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1649  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.989787  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2373  hypothetical protein  59.26 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00903594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2136  hypothetical protein  68 
 
 		 210 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129106  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2438  hypothetical protein  47.06 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0984  hypothetical protein  38.46 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2239  hypothetical protein  57.69 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6139  hypothetical protein  37.74 
 
 		 157 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2722  hypothetical protein  51.85 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.585488  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2214  BA14K family protein  30.32 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2744  hypothetical protein  57.14 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3004  BA14K family protein  61.54 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3884  BA14K family protein  28.67 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339312  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1466  hypothetical protein  57.69 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1516  hypothetical protein  57.69 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>