16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4139 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4139    100 
 
 		 408 bp  809    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.904339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4137  excinuclease ABC subunit B  91.12 
 
 		 3162 bp  504  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4146  excinuclease ABC subunit B  88.27 
 
 		 3054 bp  170  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.919849  normal  0.885523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2923  excinuclease ABC subunit B  83.41 
 
 		 3036 bp  149  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.50321  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3987  excinuclease ABC subunit B  84.18 
 
 		 3144 bp  115  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.584236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4824  excinuclease ABC subunit B  84.18 
 
 		 3036 bp  115  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.748709  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  100 
 
 		 3066 bp  83.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2495  excinuclease ABC subunit B  79.91 
 
 		 3099 bp  77.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4854  ATP-dependent helicase HrpB  97.62 
 
 		 2634 bp  75.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.951101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0059  RNA component of RNaseP  97.67 
 
 		 374 bp  69.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1782  excinuclease ABC subunit B  85.9 
 
 		 3177 bp  67.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2084  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  92.68 
 
 		 3792 bp  58  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5144  excinuclease ABC subunit B  94.29 
 
 		 2805 bp  54  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2255  error-prone DNA polymerase  92.11 
 
 		 3528 bp  52  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3238  anthranilate synthase  93.75 
 
 		 2193 bp  48.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0798  ATP-dependent DNA ligase  91.67 
 
 		 1947 bp  48.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109452  normal  0.0163574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>