120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3777 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2184  peptidase M29, aminopeptidase II  77.99 
 
 		 423 aa  679    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3777  peptidase M29, aminopeptidase II  100 
 
 		 418 aa  853    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2586  peptidase M29, aminopeptidase II  77.27 
 
 		 418 aa  682    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7164  peptidase M29, aminopeptidase II  75.36 
 
 		 418 aa  662    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0763  peptidase M29 aminopeptidase II  71.98 
 
 		 417 aa  629  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4551  peptidase M29 aminopeptidase II  72.97 
 
 		 417 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4287  peptidase M29 aminopeptidase II  71.5 
 
 		 417 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.696166 
 
 
-
 
NC_004310  BR2148  aminopeptidase PepS  71.99 
 
 		 417 aa  614  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3504  peptidase M29 aminopeptidase II  70.33 
 
 		 418 aa  612  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0137  aminopeptidase  70.56 
 
 		 416 aa  606  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1222  metalloprotease  63.94 
 
 		 416 aa  538  9.999999999999999e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000553869  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3021  aminopeptidase T  62.38 
 
 		 418 aa  511  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3472  peptidase M29 aminopeptidase II  62.62 
 
 		 419 aa  511  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.748808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3780  peptidase M29 aminopeptidase II  62.38 
 
 		 419 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3670  peptidase M29 aminopeptidase II  62.13 
 
 		 419 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0622  peptidase M29 aminopeptidase II  61.85 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5302  peptidase M29 aminopeptidase II  63.52 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0490677  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3212  aminopeptidase T  58.46 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1971  peptidase M29 aminopeptidase II  61.35 
 
 		 410 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.0591369 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1510  peptidase M29 aminopeptidase II  59.1 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.415372  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3109  peptidase M29 aminopeptidase II  64.11 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal  0.0979106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0908  peptidase M29, aminopeptidase II  54.73 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.941281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1832  peptidase M29 aminopeptidase II  50.5 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2065  peptidase M29 aminopeptidase II  45.52 
 
 		 413 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.610998  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2984  peptidase M29 aminopeptidase II  45.66 
 
 		 413 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0240  peptidase M29, aminopeptidase II  47.76 
 
 		 416 aa  364  1e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0071  peptidase M29, aminopeptidase II  47.69 
 
 		 421 aa  347  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2337  aminopeptidase  42.29 
 
 		 409 aa  340  2e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000192416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0301  aminopeptidase; peptidase_M29  41.79 
 
 		 409 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0314  aminopeptidase AmpS  41.79 
 
 		 409 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0297  aminopeptidase; peptidase_M29  41.79 
 
 		 409 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0329  aminopeptidase AmpS  41.79 
 
 		 409 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0361  aminopeptidase AmpS  41.79 
 
 		 409 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2783  peptidase M29 aminopeptidase II  38.31 
 
 		 410 aa  333  4e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0309  peptidase M29 aminopeptidase II  41.29 
 
 		 409 aa  332  5e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0403  aminopeptidase AmpS  41.54 
 
 		 409 aa  333  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0594317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0359  aminopeptidase AmpS  41.54 
 
 		 409 aa  332  6e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1965  aminopeptidase  40.2 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2253  aminopeptidase  40.2 
 
 		 411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.06051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0376  aminopeptidase AmpS  41.29 
 
 		 409 aa  328  9e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4944  aminopeptidase AmpS  41.29 
 
 		 409 aa  328  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0308  peptidase M29 aminopeptidase II  41.04 
 
 		 409 aa  326  5e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1472  aminopeptidase PepS  40.69 
 
 		 413 aa  318  1e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2902  peptidase M29 aminopeptidase II  40.2 
 
 		 409 aa  317  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1887  aminopeptidase 2  39.45 
 
 		 409 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.302559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3460  aminopeptidase 2  38.96 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.044996  hitchhiker  8.080459999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0523  PepS aminopeptidase  39.23 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00231455  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0096  aminopeptidase PepS  40.05 
 
 		 413 aa  291  1e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.216815  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0149  peptidase M29, aminopeptidase II  38.35 
 
 		 398 aa  289  6e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.868583  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1933  peptidase M29, aminopeptidase II  39.12 
 
 		 415 aa  289  7e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1967  peptidase M29 aminopeptidase II  39.12 
 
 		 415 aa  289  7e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158668  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1649  peptidase M29 aminopeptidase II  36.86 
 
 		 410 aa  286  5e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0078  peptidase M29 aminopeptidase II  38.97 
 
 		 413 aa  269  8e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1417  aminopeptidase family protein  36.45 
 
 		 413 aa  265  8e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1352  peptidase M29 aminopeptidase II  34.89 
 
 		 420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00264479  normal  0.638771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5326  peptidase M29 aminopeptidase II  39.16 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0731  peptidase M29 aminopeptidase II  35.73 
 
 		 400 aa  247  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2181  peptidase M29 aminopeptidase II  35.02 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0768961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0070  aminopeptidase II  29.98 
 
 		 412 aa  192  9e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06890  aminopeptidase protein  28.64 
 
 		 368 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2712  peptidase M29 aminopeptidase II  29.46 
 
 		 366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2644  peptidase M29, aminopeptidase II  28.15 
 
 		 366 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1401  peptidase M29 aminopeptidase II  29.86 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1192  peptidase M29 aminopeptidase II  26.92 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.318194 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0855  metalloprotease  26.17 
 
 		 375 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0868  metalloprotease  26.17 
 
 		 375 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0549814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2013  peptidase M29 aminopeptidase II  27.78 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0975831  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2642  peptidase M29 aminopeptidase II  28.22 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0109  peptidase M29 aminopeptidase II  28.64 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00036007  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2758  M29 family peptidase  29.24 
 
 		 403 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3636  peptidase M29 aminopeptidase II  27.49 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3114  peptidase M29 aminopeptidase II  26.24 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1076  peptidase M29 aminopeptidase II  30.37 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1618  peptidase M29 aminopeptidase II  31.14 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0907783  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0115  peptidase M29 aminopeptidase II  27.16 
 
 		 357 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0276  peptidase M29 aminopeptidase II  29.41 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2391  putative aminopeptidase  24.71 
 
 		 370 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.982861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1168  peptidase M29, aminopeptidase II  26.06 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.712634  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0795  peptidase M29, aminopeptidase II  26.33 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_782  aminopeptidase  26.33 
 
 		 369 aa  99.8  9e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0257  peptidase M29 aminopeptidase II  28.16 
 
 		 359 aa  98.6  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0129156 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2795  peptidase M29 aminopeptidase II  27.84 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1489  peptidase M29, aminopeptidase II  29.3 
 
 		 370 aa  97.1  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0741  peptidase M29 aminopeptidase II  35.15 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0828  peptidase M29 aminopeptidase II  36.9 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3459  putative aminopeptidase  26.51 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624241  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0911  aminopeptidase protein  25.49 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0175579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2115  peptidase M29, aminopeptidase II  26.74 
 
 		 367 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1594  peptidase M29, aminopeptidase II  26.52 
 
 		 368 aa  93.2  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000189753  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3346  peptidase M29 aminopeptidase II  25.37 
 
 		 371 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.736707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3214  putative aminopeptidase  26.27 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1777  peptidase M29 aminopeptidase II  33.33 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2212  peptidase M29, aminopeptidase II  30.11 
 
 		 401 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0278  peptidase M29 aminopeptidase II  33.16 
 
 		 367 aa  90.5  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2255  peptidase M29 aminopeptidase II  30.77 
 
 		 388 aa  90.1  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4795  putative aminopeptidase  25.37 
 
 		 371 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4820  aminopeptidase, putative  25.37 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4414  aminopeptidase  25.37 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4511  peptidase M29 aminopeptidase II  25.37 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4815  putative aminopeptidase  25.37 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>