119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5302 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3472  peptidase M29 aminopeptidase II  82.96 
 
 
419 aa  677    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.748808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3109  peptidase M29 aminopeptidase II  90.43 
 
 
420 aa  715    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal  0.0979106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3670  peptidase M29 aminopeptidase II  81.48 
 
 
419 aa  670    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3780  peptidase M29 aminopeptidase II  82.96 
 
 
419 aa  677    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5302  peptidase M29 aminopeptidase II  100 
 
 
418 aa  836    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0490677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3021  aminopeptidase T  74.88 
 
 
418 aa  622  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0763  peptidase M29 aminopeptidase II  69.63 
 
 
417 aa  565  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2148  aminopeptidase PepS  69.02 
 
 
417 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0137  aminopeptidase  66.35 
 
 
416 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4551  peptidase M29 aminopeptidase II  67 
 
 
417 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123351  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3212  aminopeptidase T  64.78 
 
 
418 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1971  peptidase M29 aminopeptidase II  68.24 
 
 
410 aa  552  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.0591369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7164  peptidase M29, aminopeptidase II  65.31 
 
 
418 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3504  peptidase M29 aminopeptidase II  67.99 
 
 
418 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1510  peptidase M29 aminopeptidase II  65.76 
 
 
409 aa  548  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.415372  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4287  peptidase M29 aminopeptidase II  66.5 
 
 
417 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.696166 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2184  peptidase M29, aminopeptidase II  67.74 
 
 
423 aa  547  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2586  peptidase M29, aminopeptidase II  66 
 
 
418 aa  546  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424521  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0622  peptidase M29 aminopeptidase II  65.45 
 
 
415 aa  538  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3777  peptidase M29, aminopeptidase II  63.52 
 
 
418 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1222  metalloprotease  61.69 
 
 
416 aa  506  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000553869  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0908  peptidase M29, aminopeptidase II  59.21 
 
 
401 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.941281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1832  peptidase M29 aminopeptidase II  55.72 
 
 
411 aa  464  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0240  peptidase M29, aminopeptidase II  53.69 
 
 
416 aa  416  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2065  peptidase M29 aminopeptidase II  46.17 
 
 
413 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.610998  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0071  peptidase M29, aminopeptidase II  51.84 
 
 
421 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2984  peptidase M29 aminopeptidase II  46.67 
 
 
413 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0309  peptidase M29 aminopeptidase II  43.03 
 
 
409 aa  368  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0359  aminopeptidase AmpS  43.03 
 
 
409 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0403  aminopeptidase AmpS  43.03 
 
 
409 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0594317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0308  peptidase M29 aminopeptidase II  42.72 
 
 
409 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0297  aminopeptidase; peptidase_M29  43.03 
 
 
409 aa  363  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0301  aminopeptidase; peptidase_M29  43.28 
 
 
409 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0361  aminopeptidase AmpS  43.03 
 
 
409 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2337  aminopeptidase  42.43 
 
 
409 aa  362  6e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000192416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0314  aminopeptidase AmpS  43.03 
 
 
409 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0376  aminopeptidase AmpS  42.79 
 
 
409 aa  361  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4944  aminopeptidase AmpS  42.79 
 
 
409 aa  361  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0329  aminopeptidase AmpS  42.79 
 
 
409 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1965  aminopeptidase  41.38 
 
 
411 aa  360  4e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2253  aminopeptidase  41.63 
 
 
411 aa  358  8e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.06051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2783  peptidase M29 aminopeptidase II  38.77 
 
 
410 aa  354  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2902  peptidase M29 aminopeptidase II  41.94 
 
 
409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1887  aminopeptidase 2  40.25 
 
 
409 aa  330  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.302559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3460  aminopeptidase 2  39.26 
 
 
423 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.044996  hitchhiker  8.080459999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0523  PepS aminopeptidase  40.34 
 
 
409 aa  312  5.999999999999999e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00231455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0078  peptidase M29 aminopeptidase II  42.4 
 
 
413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0096  aminopeptidase PepS  39.26 
 
 
413 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.216815  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1472  aminopeptidase PepS  38.42 
 
 
413 aa  301  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1933  peptidase M29, aminopeptidase II  38.48 
 
 
415 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1967  peptidase M29 aminopeptidase II  38.48 
 
 
415 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158668  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1649  peptidase M29 aminopeptidase II  36.19 
 
 
410 aa  291  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1352  peptidase M29 aminopeptidase II  36.27 
 
 
420 aa  290  3e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00264479  normal  0.638771 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0149  peptidase M29, aminopeptidase II  38.67 
 
 
398 aa  288  1e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.868583  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1417  aminopeptidase family protein  37.93 
 
 
413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0731  peptidase M29 aminopeptidase II  35.05 
 
 
400 aa  271  1e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5326  peptidase M29 aminopeptidase II  42.18 
 
 
399 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2181  peptidase M29 aminopeptidase II  39.51 
 
 
404 aa  229  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0768961  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0070  aminopeptidase II  30.75 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1401  peptidase M29 aminopeptidase II  29.63 
 
 
367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2712  peptidase M29 aminopeptidase II  30.42 
 
 
366 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2644  peptidase M29, aminopeptidase II  29.51 
 
 
366 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06890  aminopeptidase protein  25.68 
 
 
368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2642  peptidase M29 aminopeptidase II  27.82 
 
 
366 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0278  peptidase M29 aminopeptidase II  27.23 
 
 
367 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1168  peptidase M29, aminopeptidase II  27.59 
 
 
388 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.712634  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1777  peptidase M29 aminopeptidase II  26.27 
 
 
380 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1489  peptidase M29, aminopeptidase II  30.59 
 
 
370 aa  97.4  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1909  peptidase M29, aminopeptidase II  25.06 
 
 
368 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.216085  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0276  peptidase M29 aminopeptidase II  27.36 
 
 
406 aa  95.5  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2014  peptidase M29 aminopeptidase II  27.05 
 
 
359 aa  94.4  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2758  M29 family peptidase  28.57 
 
 
403 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3346  peptidase M29 aminopeptidase II  24.6 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.736707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0855  metalloprotease  25.71 
 
 
375 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1192  peptidase M29 aminopeptidase II  26.62 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.318194 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4795  putative aminopeptidase  24.72 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0443  putative aminopeptidase  24.72 
 
 
371 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2255  peptidase M29 aminopeptidase II  26.89 
 
 
388 aa  91.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3114  peptidase M29 aminopeptidase II  26.96 
 
 
367 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185719  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0432  peptidase M29 aminopeptidase II  26.51 
 
 
360 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3636  peptidase M29 aminopeptidase II  24.86 
 
 
371 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2115  peptidase M29, aminopeptidase II  27.98 
 
 
367 aa  90.1  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2391  putative aminopeptidase  24.53 
 
 
370 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.982861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1618  peptidase M29 aminopeptidase II  25.51 
 
 
405 aa  90.1  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0907783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4511  peptidase M29 aminopeptidase II  24.44 
 
 
371 aa  89.7  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4820  aminopeptidase, putative  24.44 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4414  aminopeptidase  24.44 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4815  putative aminopeptidase  24.44 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4799  putative aminopeptidase  24.44 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0828  peptidase M29 aminopeptidase II  26.96 
 
 
365 aa  89.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0868  metalloprotease  25.19 
 
 
375 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0549814  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0257  peptidase M29 aminopeptidase II  28.05 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0129156 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4432  aminopeptidase  24.17 
 
 
371 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0115  peptidase M29 aminopeptidase II  27.11 
 
 
357 aa  87.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2973  peptidase M29 aminopeptidase II  26.03 
 
 
367 aa  87.4  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000872397 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4579  aminopeptidase  24.17 
 
 
371 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4933  aminopeptidase  24.17 
 
 
371 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0109  peptidase M29 aminopeptidase II  27.15 
 
 
357 aa  87  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00036007  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2013  peptidase M29 aminopeptidase II  26.58 
 
 
410 aa  87  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0975831  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0741  peptidase M29 aminopeptidase II  27.87 
 
 
363 aa  87  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>