119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2586 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR2148  aminopeptidase PepS  76.83 
 
 
417 aa  655    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2184  peptidase M29, aminopeptidase II  90.43 
 
 
423 aa  785    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3777  peptidase M29, aminopeptidase II  77.27 
 
 
418 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2586  peptidase M29, aminopeptidase II  100 
 
 
418 aa  862    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7164  peptidase M29, aminopeptidase II  78.71 
 
 
418 aa  699    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3504  peptidase M29 aminopeptidase II  74.64 
 
 
418 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0763  peptidase M29 aminopeptidase II  77.4 
 
 
417 aa  662    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4287  peptidase M29 aminopeptidase II  75.92 
 
 
417 aa  653    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.696166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0137  aminopeptidase  74.27 
 
 
416 aa  647    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4551  peptidase M29 aminopeptidase II  76.9 
 
 
417 aa  661    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123351  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1222  metalloprotease  69.53 
 
 
416 aa  580  1e-164  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000553869  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3021  aminopeptidase T  66.83 
 
 
418 aa  558  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0622  peptidase M29 aminopeptidase II  66.58 
 
 
415 aa  556  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3670  peptidase M29 aminopeptidase II  64.44 
 
 
419 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5302  peptidase M29 aminopeptidase II  66 
 
 
418 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0490677  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3780  peptidase M29 aminopeptidase II  63.96 
 
 
419 aa  541  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3472  peptidase M29 aminopeptidase II  63.96 
 
 
419 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.748808 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1510  peptidase M29 aminopeptidase II  63.09 
 
 
409 aa  528  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.415372  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3212  aminopeptidase T  59.95 
 
 
418 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3109  peptidase M29 aminopeptidase II  66.34 
 
 
420 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal  0.0979106 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1971  peptidase M29 aminopeptidase II  61.85 
 
 
410 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.0591369 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1832  peptidase M29 aminopeptidase II  51.49 
 
 
411 aa  435  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0908  peptidase M29, aminopeptidase II  53.98 
 
 
401 aa  434  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.941281  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2065  peptidase M29 aminopeptidase II  46.77 
 
 
413 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.610998  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2984  peptidase M29 aminopeptidase II  46.15 
 
 
413 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0240  peptidase M29, aminopeptidase II  47.76 
 
 
416 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0301  aminopeptidase; peptidase_M29  43.78 
 
 
409 aa  363  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0297  aminopeptidase; peptidase_M29  43.28 
 
 
409 aa  362  6e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0361  aminopeptidase AmpS  43.28 
 
 
409 aa  362  6e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2337  aminopeptidase  42.54 
 
 
409 aa  362  8e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000192416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0314  aminopeptidase AmpS  43.03 
 
 
409 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0308  peptidase M29 aminopeptidase II  43.28 
 
 
409 aa  361  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0309  peptidase M29 aminopeptidase II  43.03 
 
 
409 aa  360  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0376  aminopeptidase AmpS  43.28 
 
 
409 aa  360  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4944  aminopeptidase AmpS  43.28 
 
 
409 aa  360  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0359  aminopeptidase AmpS  43.03 
 
 
409 aa  358  7e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0329  aminopeptidase AmpS  42.79 
 
 
409 aa  358  8e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0403  aminopeptidase AmpS  43.03 
 
 
409 aa  358  8e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0594317  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0071  peptidase M29, aminopeptidase II  46.65 
 
 
421 aa  346  5e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1887  aminopeptidase 2  41.69 
 
 
409 aa  330  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.302559  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2783  peptidase M29 aminopeptidase II  39.55 
 
 
410 aa  330  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3460  aminopeptidase 2  40.94 
 
 
423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.044996  hitchhiker  8.080459999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1965  aminopeptidase  39.21 
 
 
411 aa  328  8e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0523  PepS aminopeptidase  42.48 
 
 
409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00231455  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2253  aminopeptidase  39.21 
 
 
411 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.06051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2902  peptidase M29 aminopeptidase II  39.46 
 
 
409 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020205  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1933  peptidase M29, aminopeptidase II  40.1 
 
 
415 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1967  peptidase M29 aminopeptidase II  40.1 
 
 
415 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158668  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1472  aminopeptidase PepS  37.72 
 
 
413 aa  301  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1649  peptidase M29 aminopeptidase II  37.1 
 
 
410 aa  291  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0078  peptidase M29 aminopeptidase II  39.22 
 
 
413 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0096  aminopeptidase PepS  37.47 
 
 
413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.216815  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1417  aminopeptidase family protein  38.67 
 
 
413 aa  280  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1352  peptidase M29 aminopeptidase II  34.76 
 
 
420 aa  276  6e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00264479  normal  0.638771 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0149  peptidase M29, aminopeptidase II  37 
 
 
398 aa  275  9e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.868583  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5326  peptidase M29 aminopeptidase II  39.9 
 
 
399 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0731  peptidase M29 aminopeptidase II  34.83 
 
 
400 aa  246  6.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2181  peptidase M29 aminopeptidase II  35.54 
 
 
404 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0768961  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0070  aminopeptidase II  30.96 
 
 
412 aa  203  4e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2712  peptidase M29 aminopeptidase II  31.93 
 
 
366 aa  140  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2644  peptidase M29, aminopeptidase II  30.03 
 
 
366 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06890  aminopeptidase protein  29.32 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1401  peptidase M29 aminopeptidase II  31.27 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1168  peptidase M29, aminopeptidase II  28.33 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.712634  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0795  peptidase M29, aminopeptidase II  26.45 
 
 
389 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_782  aminopeptidase  26.2 
 
 
369 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0115  peptidase M29 aminopeptidase II  28.54 
 
 
357 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3214  putative aminopeptidase  28.29 
 
 
371 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2642  peptidase M29 aminopeptidase II  27.2 
 
 
366 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1594  peptidase M29, aminopeptidase II  27.38 
 
 
368 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000189753  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1909  peptidase M29, aminopeptidase II  28.02 
 
 
368 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.216085  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1192  peptidase M29 aminopeptidase II  25.76 
 
 
399 aa  104  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.318194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3636  peptidase M29 aminopeptidase II  26.72 
 
 
371 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0109  peptidase M29 aminopeptidase II  27.89 
 
 
357 aa  103  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00036007  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3114  peptidase M29 aminopeptidase II  26.37 
 
 
367 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185719  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0911  aminopeptidase protein  24.94 
 
 
369 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0175579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2115  peptidase M29, aminopeptidase II  26.91 
 
 
367 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0276  peptidase M29 aminopeptidase II  27.89 
 
 
406 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0855  metalloprotease  25.57 
 
 
375 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2391  putative aminopeptidase  24.88 
 
 
370 aa  99.8  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.982861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0868  metalloprotease  25.63 
 
 
375 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0549814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2013  peptidase M29 aminopeptidase II  28.51 
 
 
410 aa  99  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0975831  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0257  peptidase M29 aminopeptidase II  27.3 
 
 
359 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0129156 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1618  peptidase M29 aminopeptidase II  27.87 
 
 
405 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0907783  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2758  M29 family peptidase  27.14 
 
 
403 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0828  peptidase M29 aminopeptidase II  28.74 
 
 
365 aa  97.8  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0432  peptidase M29 aminopeptidase II  30.43 
 
 
360 aa  97.1  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1489  peptidase M29, aminopeptidase II  29.54 
 
 
370 aa  95.5  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0741  peptidase M29 aminopeptidase II  28.22 
 
 
363 aa  95.5  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3459  putative aminopeptidase  26.02 
 
 
371 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1842  peptidase M29 aminopeptidase II  26.88 
 
 
366 aa  93.6  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4795  putative aminopeptidase  26.62 
 
 
371 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4820  aminopeptidase, putative  26.62 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4414  aminopeptidase  26.62 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3346  peptidase M29 aminopeptidase II  26.12 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.736707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4815  putative aminopeptidase  26.62 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4799  putative aminopeptidase  26.62 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2973  peptidase M29 aminopeptidase II  27.05 
 
 
367 aa  93.6  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000872397 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1311  peptidase M29 aminopeptidase II  27.05 
 
 
367 aa  93.2  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000144193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4432  aminopeptidase  26.32 
 
 
371 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>