139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3214 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3214  putative aminopeptidase  100 
 
 
371 aa  773    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3636  peptidase M29 aminopeptidase II  78.17 
 
 
371 aa  617  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3459  putative aminopeptidase  69.81 
 
 
371 aa  549  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2391  putative aminopeptidase  68.46 
 
 
370 aa  537  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.982861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4820  aminopeptidase, putative  66.85 
 
 
371 aa  533  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4414  aminopeptidase  66.85 
 
 
371 aa  533  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4432  aminopeptidase  66.58 
 
 
371 aa  531  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3346  peptidase M29 aminopeptidase II  67.12 
 
 
371 aa  533  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.736707  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4511  peptidase M29 aminopeptidase II  66.85 
 
 
371 aa  531  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4815  putative aminopeptidase  66.85 
 
 
371 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4799  putative aminopeptidase  66.85 
 
 
371 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4579  aminopeptidase  66.58 
 
 
371 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4933  aminopeptidase  66.58 
 
 
371 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4795  putative aminopeptidase  66.58 
 
 
371 aa  530  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0443  putative aminopeptidase  66.58 
 
 
371 aa  529  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1544  peptidase M29 aminopeptidase II  64.96 
 
 
371 aa  509  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2842  aminopeptidase  60.43 
 
 
374 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.180088  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3002  peptidase M29 aminopeptidase II  53.78 
 
 
374 aa  415  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0261294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3265  peptidase M29, aminopeptidase II  59.34 
 
 
304 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139393  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1280  aminopeptidase  49.18 
 
 
369 aa  368  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1842  peptidase M29 aminopeptidase II  50.81 
 
 
366 aa  347  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2973  peptidase M29 aminopeptidase II  48.66 
 
 
367 aa  343  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000872397 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1311  peptidase M29 aminopeptidase II  48.66 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000144193  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1909  peptidase M29, aminopeptidase II  47.44 
 
 
368 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.216085  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2115  peptidase M29, aminopeptidase II  46.51 
 
 
367 aa  332  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1594  peptidase M29, aminopeptidase II  45.19 
 
 
368 aa  319  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000189753  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3114  peptidase M29 aminopeptidase II  33.6 
 
 
367 aa  226  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185719  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_782  aminopeptidase  36.12 
 
 
369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1168  peptidase M29, aminopeptidase II  32.97 
 
 
388 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.712634  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0911  aminopeptidase protein  34.32 
 
 
369 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0175579  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0795  peptidase M29, aminopeptidase II  34.86 
 
 
389 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2644  peptidase M29, aminopeptidase II  33.07 
 
 
366 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1401  peptidase M29 aminopeptidase II  34.14 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2642  peptidase M29 aminopeptidase II  32.97 
 
 
366 aa  209  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2712  peptidase M29 aminopeptidase II  31.62 
 
 
366 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06890  aminopeptidase protein  32.61 
 
 
368 aa  203  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0278  peptidase M29 aminopeptidase II  30.81 
 
 
367 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0109  peptidase M29 aminopeptidase II  32.22 
 
 
357 aa  190  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00036007  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1777  peptidase M29 aminopeptidase II  29.84 
 
 
380 aa  186  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0855  metalloprotease  29.21 
 
 
375 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0868  metalloprotease  28.95 
 
 
375 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0549814  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2255  peptidase M29 aminopeptidase II  29.54 
 
 
388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0828  peptidase M29 aminopeptidase II  31.52 
 
 
365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0257  peptidase M29 aminopeptidase II  29.78 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0129156 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0115  peptidase M29 aminopeptidase II  29.61 
 
 
357 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0432  peptidase M29 aminopeptidase II  28.46 
 
 
360 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1076  peptidase M29 aminopeptidase II  28.85 
 
 
352 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1834  peptidase M29 aminopeptidase II  31.82 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2014  peptidase M29 aminopeptidase II  29.19 
 
 
359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0741  peptidase M29 aminopeptidase II  27.72 
 
 
363 aa  160  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1489  peptidase M29, aminopeptidase II  28.01 
 
 
370 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2666  peptidase M29 aminopeptidase II  28.29 
 
 
373 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3312  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like  28.06 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.390308  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2586  peptidase M29, aminopeptidase II  28.29 
 
 
418 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424521  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0731  peptidase M29 aminopeptidase II  26.76 
 
 
400 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7164  peptidase M29, aminopeptidase II  25.48 
 
 
418 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1832  peptidase M29 aminopeptidase II  26.3 
 
 
411 aa  99.4  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0763  peptidase M29 aminopeptidase II  26.04 
 
 
417 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2795  peptidase M29 aminopeptidase II  25.27 
 
 
399 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3021  aminopeptidase T  24.32 
 
 
418 aa  94  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4551  peptidase M29 aminopeptidase II  26.46 
 
 
417 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123351  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3670  peptidase M29 aminopeptidase II  26.56 
 
 
419 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_004310  BR2148  aminopeptidase PepS  25.86 
 
 
417 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2184  peptidase M29, aminopeptidase II  26.28 
 
 
423 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3777  peptidase M29, aminopeptidase II  26.27 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0622  peptidase M29 aminopeptidase II  25.47 
 
 
415 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1192  peptidase M29 aminopeptidase II  22.6 
 
 
399 aa  90.5  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.318194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0276  peptidase M29 aminopeptidase II  25.74 
 
 
406 aa  90.5  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2212  peptidase M29, aminopeptidase II  24.2 
 
 
401 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0149  peptidase M29, aminopeptidase II  30.5 
 
 
398 aa  90.1  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.868583  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4287  peptidase M29 aminopeptidase II  26.08 
 
 
417 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.696166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1510  peptidase M29 aminopeptidase II  25.37 
 
 
409 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.415372  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2758  M29 family peptidase  22.65 
 
 
403 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3504  peptidase M29 aminopeptidase II  25.91 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3780  peptidase M29 aminopeptidase II  27.01 
 
 
419 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0137  aminopeptidase  25.06 
 
 
416 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3472  peptidase M29 aminopeptidase II  27.01 
 
 
419 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.748808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5302  peptidase M29 aminopeptidase II  25.53 
 
 
418 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0490677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3109  peptidase M29 aminopeptidase II  25.42 
 
 
420 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal  0.0979106 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0096  aminopeptidase PepS  25.84 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.216815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3163  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  24.38 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0908  peptidase M29, aminopeptidase II  25.34 
 
 
401 aa  82.4  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.941281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1887  aminopeptidase 2  24.09 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.302559  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1649  peptidase M29 aminopeptidase II  26.16 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1971  peptidase M29 aminopeptidase II  35.57 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.0591369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3212  aminopeptidase T  24.52 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3460  aminopeptidase 2  22.51 
 
 
423 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.044996  hitchhiker  8.080459999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0240  peptidase M29, aminopeptidase II  33.53 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1618  peptidase M29 aminopeptidase II  22.92 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0907783  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0523  PepS aminopeptidase  36.07 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00231455  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2013  peptidase M29 aminopeptidase II  23.19 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0975831  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0078  peptidase M29 aminopeptidase II  32.14 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1933  peptidase M29, aminopeptidase II  25.63 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1967  peptidase M29 aminopeptidase II  25.63 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2984  peptidase M29 aminopeptidase II  24.5 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1222  metalloprotease  25.19 
 
 
416 aa  73.6  0.000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000553869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2065  peptidase M29 aminopeptidase II  24.1 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.610998  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1472  aminopeptidase PepS  31.37 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0308  peptidase M29 aminopeptidase II  33.33 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1417  aminopeptidase family protein  24.75 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>