118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1352 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1352  peptidase M29 aminopeptidase II  100 
 
 		 420 aa  872    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00264479  normal  0.638771 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1965  aminopeptidase  43.07 
 
 		 411 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2253  aminopeptidase  43.07 
 
 		 411 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.06051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2984  peptidase M29 aminopeptidase II  42.36 
 
 		 413 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2065  peptidase M29 aminopeptidase II  42.47 
 
 		 413 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.610998  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2902  peptidase M29 aminopeptidase II  41.58 
 
 		 409 aa  346  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0309  peptidase M29 aminopeptidase II  40.34 
 
 		 409 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0308  peptidase M29 aminopeptidase II  40.1 
 
 		 409 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0359  aminopeptidase AmpS  39.85 
 
 		 409 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0403  aminopeptidase AmpS  39.85 
 
 		 409 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0594317  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0329  aminopeptidase AmpS  40.1 
 
 		 409 aa  318  9e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0376  aminopeptidase AmpS  39.36 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4944  aminopeptidase AmpS  39.36 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0297  aminopeptidase; peptidase_M29  39.85 
 
 		 409 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0361  aminopeptidase AmpS  39.85 
 
 		 409 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0314  aminopeptidase AmpS  39.85 
 
 		 409 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0301  aminopeptidase; peptidase_M29  39.61 
 
 		 409 aa  316  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2783  peptidase M29 aminopeptidase II  37.86 
 
 		 410 aa  316  5e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1649  peptidase M29 aminopeptidase II  37.23 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0096  aminopeptidase PepS  37.86 
 
 		 413 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.216815  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2337  aminopeptidase  37.87 
 
 		 409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000192416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3021  aminopeptidase T  36.27 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0078  peptidase M29 aminopeptidase II  38.65 
 
 		 413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1510  peptidase M29 aminopeptidase II  36.82 
 
 		 409 aa  302  6.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.415372  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0523  PepS aminopeptidase  37.16 
 
 		 409 aa  301  2e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00231455  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1971  peptidase M29 aminopeptidase II  36.36 
 
 		 410 aa  293  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.0591369 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1887  aminopeptidase 2  36.52 
 
 		 409 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.302559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5302  peptidase M29 aminopeptidase II  36.27 
 
 		 418 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0490677  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0137  aminopeptidase  36.97 
 
 		 416 aa  290  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1472  aminopeptidase PepS  35.84 
 
 		 413 aa  286  5e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3460  aminopeptidase 2  36.27 
 
 		 423 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.044996  hitchhiker  8.080459999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1933  peptidase M29, aminopeptidase II  35.78 
 
 		 415 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1967  peptidase M29 aminopeptidase II  35.78 
 
 		 415 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158668  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4551  peptidase M29 aminopeptidase II  37.1 
 
 		 417 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7164  peptidase M29, aminopeptidase II  36.36 
 
 		 418 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3504  peptidase M29 aminopeptidase II  36.28 
 
 		 418 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0763  peptidase M29 aminopeptidase II  35.46 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0149  peptidase M29, aminopeptidase II  36.22 
 
 		 398 aa  280  4e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.868583  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4287  peptidase M29 aminopeptidase II  36.86 
 
 		 417 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.696166 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1222  metalloprotease  37.44 
 
 		 416 aa  279  6e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000553869  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3670  peptidase M29 aminopeptidase II  35.21 
 
 		 419 aa  279  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1832  peptidase M29 aminopeptidase II  34.64 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3212  aminopeptidase T  33.73 
 
 		 418 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0071  peptidase M29, aminopeptidase II  37.35 
 
 		 421 aa  278  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0731  peptidase M29 aminopeptidase II  37.96 
 
 		 400 aa  278  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3472  peptidase M29 aminopeptidase II  34.72 
 
 		 419 aa  276  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.748808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3780  peptidase M29 aminopeptidase II  34.72 
 
 		 419 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2586  peptidase M29, aminopeptidase II  34.76 
 
 		 418 aa  276  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424521  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0622  peptidase M29 aminopeptidase II  35.06 
 
 		 415 aa  276  7e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_004310  BR2148  aminopeptidase PepS  36.52 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1417  aminopeptidase family protein  35.78 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2184  peptidase M29, aminopeptidase II  34.83 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3109  peptidase M29 aminopeptidase II  35.78 
 
 		 420 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal  0.0979106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0908  peptidase M29, aminopeptidase II  34.16 
 
 		 401 aa  262  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.941281  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0240  peptidase M29, aminopeptidase II  33.25 
 
 		 416 aa  260  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3777  peptidase M29, aminopeptidase II  34.89 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0070  aminopeptidase II  31.37 
 
 		 412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5326  peptidase M29 aminopeptidase II  32.01 
 
 		 399 aa  216  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2181  peptidase M29 aminopeptidase II  27.86 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0768961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2758  M29 family peptidase  24.52 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06890  aminopeptidase protein  25.62 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1401  peptidase M29 aminopeptidase II  24.55 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1192  peptidase M29 aminopeptidase II  23.35 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.318194 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1168  peptidase M29, aminopeptidase II  27.27 
 
 		 388 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.712634  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2014  peptidase M29 aminopeptidase II  26.17 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2712  peptidase M29 aminopeptidase II  26.55 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2013  peptidase M29 aminopeptidase II  25.94 
 
 		 410 aa  94  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0975831  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0278  peptidase M29 aminopeptidase II  24.87 
 
 		 367 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0276  peptidase M29 aminopeptidase II  26.07 
 
 		 406 aa  91.7  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2644  peptidase M29, aminopeptidase II  26.89 
 
 		 366 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0115  peptidase M29 aminopeptidase II  26.4 
 
 		 357 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2795  peptidase M29 aminopeptidase II  26.23 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2212  peptidase M29, aminopeptidase II  26.93 
 
 		 401 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2642  peptidase M29 aminopeptidase II  28.87 
 
 		 366 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0828  peptidase M29 aminopeptidase II  24.87 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0109  peptidase M29 aminopeptidase II  26.42 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00036007  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1076  peptidase M29 aminopeptidase II  26.46 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0868  metalloprotease  24.62 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0549814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1618  peptidase M29 aminopeptidase II  24.76 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0907783  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0855  metalloprotease  25.7 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1909  peptidase M29, aminopeptidase II  24.93 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.216085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3114  peptidase M29 aminopeptidase II  25.91 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185719  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0795  peptidase M29, aminopeptidase II  23.82 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1777  peptidase M29 aminopeptidase II  22.78 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0432  peptidase M29 aminopeptidase II  29.57 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2255  peptidase M29 aminopeptidase II  29.35 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1594  peptidase M29, aminopeptidase II  25.28 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000189753  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3459  putative aminopeptidase  24.24 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624241  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1489  peptidase M29, aminopeptidase II  26.45 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_782  aminopeptidase  23.8 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0257  peptidase M29 aminopeptidase II  27.27 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0129156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2115  peptidase M29, aminopeptidase II  23.69 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0911  aminopeptidase protein  23.23 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0175579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0741  peptidase M29 aminopeptidase II  23.6 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1834  peptidase M29 aminopeptidase II  28.09 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2666  peptidase M29 aminopeptidase II  23.32 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2973  peptidase M29 aminopeptidase II  22.51 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000872397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3636  peptidase M29 aminopeptidase II  24.52 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1311  peptidase M29 aminopeptidase II  21.99 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000144193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2391  putative aminopeptidase  26.2 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.982861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>