103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1608 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1608  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  358  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4101  hypothetical protein  80.62 
 
 		 176 aa  266  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485974  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1352  hypothetical protein  65.27 
 
 		 176 aa  226  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395869  hitchhiker  0.00176642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4727  acetyltransferase, gnat family  45.51 
 
 		 161 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1354  GCN5-related N-acetyltransferase  46.34 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4587  GCN5-related N-acetyltransferase  48.34 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0281  GCN5-related N-acetyltransferase  44.1 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1783  hypothetical protein  42.58 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0595356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3547  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 		 164 aa  127  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0265536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3429  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 		 164 aa  127  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0066  acetyltransferase, gnat family  41.03 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0299506  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4242  hypothetical protein  39.74 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0787  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1571  GCN5-related N-acetyltransferase  42.42 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.23826  normal  0.834903 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1136  GCN5-related N-acetyltransferase  44.38 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1417  acetyltransferase, GNAT family  44.38 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4664  acetyltransferase, gnat family  38.27 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.374282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4713  GNAT family acetyltransferase  38.27 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.158264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  42.95 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3704  GCN5-related N-acetyltransferase  42.95 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4573  acetyltransferase, gnat family  37.65 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.283887  normal  0.34039 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  40.49 
 
 		 179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2044  acetyltransferase  39.75 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0252037  hitchhiker  0.0082422 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10937  hypothetical protein  38.41 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39800  N-acetyltransferase  45.45 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0945  hypothetical protein  41.03 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.58539  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1729  histone acetyltransferase HPA2/related acetyltransferase  43.12 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000641466  normal  0.235858 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  40.49 
 
 		 167 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0302  acetyltransferase, gnat family  36.65 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00939281  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3907  GCN5-related protein N-acetyltransferase  39.1 
 
 		 168 aa  108  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0919  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1717  GCN5-related N-acetyltransferase  39.07 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.400232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2345  GCN5-related N-acetyltransferase  36.94 
 
 		 163 aa  98.6  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4424  hypothetical protein  33.54 
 
 		 169 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000808902  normal  0.0637784 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4607  hypothetical protein  33.54 
 
 		 169 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.776169 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4403  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 		 169 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.527623 
 
 
-
 
NC_003296  RS02184  hypothetical protein  37.18 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3551  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.360876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  37.75 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1273  hypothetical protein  34.57 
 
 		 167 aa  94.4  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.375788  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2101  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 		 166 aa  94  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0948577  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  39.19 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000739344  normal  0.234454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1212  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4868  hypothetical protein  36.77 
 
 		 171 aa  90.9  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3270  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 		 173 aa  90.9  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2170  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2580  GCN5-related N-acetyltransferase  40.38 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2856  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0818  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5375  GCN5-related N-acetyltransferase  33.97 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0750158  normal  0.794921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1170  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 163 aa  87.8  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.474903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2493  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 167 aa  87.8  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.268854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3138  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4862  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3303  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7545  GCN5-related N-acetyltransferase  37.75 
 
 		 168 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013677 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4537  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.69779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1884  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4777  hypothetical protein  32.69 
 
 		 175 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3939  hypothetical protein  30.32 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3959  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3838  hypothetical protein  35.17 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0636  acetyltransferase  31.41 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1639  hypothetical protein, putative phage gene  31.21 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0765  hypothetical protein  32.05 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0916  hypothetical protein  32.05 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0645172  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3093  GNAT family acetyltransferase  34.18 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3212  GNAT family acetyltransferase  34.18 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.649862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1620  GCN5-related N-acetyltransferase  38.22 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2748  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1986  hypothetical protein  31.41 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3108  acetyltransferase, gnat family  33.54 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142937 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0498  GCN5-related N-acetyltransferase  32.84 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.814573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2940  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2983  hypothetical protein  30.13 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1842  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4968  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2852  hypothetical protein  29.94 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.766194  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3025  acetyltransferase, gnat family  32.28 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5177  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2320  hypothetical protein  37.31 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0759  hypothetical protein  27.67 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0540  hypothetical protein, putative phage gene  28.3 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4633  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4287  GCN5-related N-acetyltransferase  31.1 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0724  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0781072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3628  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0753  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240345  unclonable  0.0000115311 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0747  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000712502 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3600  acetyltransferase  36.54 
 
 		 113 aa  62  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000439996  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0411  hypothetical protein  25.97 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192601  normal  0.650281 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00377  putative acetyltransferase  23.08 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00812467  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0501  acetyltransferase  23.08 
 
 		 180 aa  52  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0461  acetyltransferase  23.08 
 
 		 180 aa  52  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.231412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00381  hypothetical protein  23.08 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00961251  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0466  acetyltransferase  22.44 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.761615  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1540  GCN5-related N-acetyltransferase  30.89 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4307  hypothetical protein  30.19 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3602  hypothetical protein  39.68 
 
 		 81 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000320935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>