40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0466 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0466  acetyltransferase  100 
 
 
180 aa  371  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.761615  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0461  acetyltransferase  97.78 
 
 
180 aa  363  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.231412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0501  acetyltransferase  97.78 
 
 
180 aa  363  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00377  putative acetyltransferase  97.22 
 
 
180 aa  361  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00812467  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00381  hypothetical protein  97.22 
 
 
180 aa  361  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00961251  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000140  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
186 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44815  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0060  acetyltransferase  29.63 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0967209  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2345  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
163 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0498  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
163 aa  58.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.814573  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4101  hypothetical protein  25.49 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485974  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4537  GCN5-related N-acetyltransferase  24.64 
 
 
166 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.69779 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0302  acetyltransferase, gnat family  29.2 
 
 
160 aa  54.7  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00939281  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02184  hypothetical protein  27.61 
 
 
163 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2493  GCN5-related N-acetyltransferase  24.63 
 
 
167 aa  51.2  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.268854  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1608  hypothetical protein  22.44 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136851  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0916  hypothetical protein  23.23 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0645172  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0765  hypothetical protein  23.23 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1273  hypothetical protein  23.84 
 
 
167 aa  48.1  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.375788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0787  GCN5-related N-acetyltransferase  25.53 
 
 
169 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1639  hypothetical protein, putative phage gene  23.23 
 
 
167 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1986  hypothetical protein  31.76 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0636  acetyltransferase  21.94 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2748  GCN5-related N-acetyltransferase  24.65 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116801  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3303  GCN5-related N-acetyltransferase  26.43 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2170  GCN5-related N-acetyltransferase  26.81 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4862  GCN5-related N-acetyltransferase  26.43 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1352  hypothetical protein  20.92 
 
 
176 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395869  hitchhiker  0.00176642 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  26.81 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3704  GCN5-related N-acetyltransferase  24.43 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  24.43 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0919  GCN5-related N-acetyltransferase  26.36 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0281  GCN5-related N-acetyltransferase  24.41 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1359  GCN5-related N-acetyltransferase  27.83 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1717  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.400232  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2101  GCN5-related N-acetyltransferase  22.3 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0948577  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1783  hypothetical protein  24.41 
 
 
155 aa  43.5  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0595356  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1212  GCN5-related N-acetyltransferase  22.3 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3959  GCN5-related N-acetyltransferase  21.54 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4777  hypothetical protein  27.41 
 
 
175 aa  41.2  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3939  hypothetical protein  27.41 
 
 
175 aa  40.8  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>