110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0060 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004349  SO_A0060  acetyltransferase  100 
 
 
175 aa  362  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0967209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0501  acetyltransferase  30.25 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0461  acetyltransferase  30.25 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.231412  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000140  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44815  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00377  putative acetyltransferase  29.63 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00812467  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0466  acetyltransferase  29.63 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.761615  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00381  hypothetical protein  29.63 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00961251  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0919  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0945  hypothetical protein  31.54 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.58539  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0498  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.814573  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3551  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.360876  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1354  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1136  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
164 aa  61.6  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1417  acetyltransferase, GNAT family  29.01 
 
 
164 aa  61.6  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
167 aa  61.6  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2983  hypothetical protein  30.5 
 
 
167 aa  60.8  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2493  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.268854  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5177  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3429  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1783  hypothetical protein  25.53 
 
 
155 aa  59.3  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0595356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2345  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2170  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0787  GCN5-related N-acetyltransferase  28.03 
 
 
169 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10937  hypothetical protein  29.01 
 
 
166 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3547  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0265536  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4587  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
171 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2044  acetyltransferase  29.29 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0252037  hitchhiker  0.0082422 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0678  GCN5-related N-acetyltransferase  24.14 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.958857  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1571  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.23826  normal  0.834903 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7545  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.013677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0281  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4664  acetyltransferase, gnat family  25.56 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.374282  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4573  acetyltransferase, gnat family  25.56 
 
 
163 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.283887  normal  0.34039 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4713  GNAT family acetyltransferase  25.56 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.158264  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4537  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
166 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.69779 
 
 
-
 
NC_003296  RS02184  hypothetical protein  27.07 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0302  acetyltransferase, gnat family  30.71 
 
 
160 aa  54.7  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00939281  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4862  GCN5-related N-acetyltransferase  28.91 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3303  GCN5-related N-acetyltransferase  28.91 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0818  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103154  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5375  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0750158  normal  0.794921 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1729  histone acetyltransferase HPA2/related acetyltransferase  27.4 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000641466  normal  0.235858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39800  N-acetyltransferase  28.57 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3270  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
173 aa  51.2  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1717  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
167 aa  50.8  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.400232  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3628  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0753  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240345  unclonable  0.0000115311 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0747  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000712502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0724  GCN5-related N-acetyltransferase  26.88 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0781072  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3138  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 
215 aa  48.9  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000739344  normal  0.234454 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3939  hypothetical protein  28.46 
 
 
175 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0540  hypothetical protein, putative phage gene  26.88 
 
 
176 aa  48.5  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4633  GCN5-related N-acetyltransferase  26.88 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4777  hypothetical protein  28.46 
 
 
175 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3025  acetyltransferase, gnat family  28.14 
 
 
175 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3108  acetyltransferase, gnat family  29.17 
 
 
175 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1170  GCN5-related N-acetyltransferase  25.76 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.474903  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0759  hypothetical protein  25.79 
 
 
177 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1884  GCN5-related N-acetyltransferase  25.33 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3093  GNAT family acetyltransferase  29.17 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131221  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3212  GNAT family acetyltransferase  29.17 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.649862  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4727  acetyltransferase, gnat family  23.57 
 
 
161 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4242  hypothetical protein  25.76 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4889  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4101  hypothetical protein  26.06 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00485974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1863  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3907  GCN5-related protein N-acetyltransferase  27.82 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3838  hypothetical protein  26.89 
 
 
175 aa  45.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4868  hypothetical protein  30.6 
 
 
171 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0647  GCN5-related N-acetyltransferase  40.3 
 
 
148 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4424  hypothetical protein  23.88 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000808902  normal  0.0637784 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1128  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
159 aa  44.7  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412545  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4607  hypothetical protein  23.88 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.776169 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4403  GCN5-related N-acetyltransferase  23.88 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.527623 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3704  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1850  spermine/spermidine acetyltransferase  33 
 
 
156 aa  44.3  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.20459  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0066  acetyltransferase, gnat family  27.4 
 
 
161 aa  44.7  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0299506  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1352  hypothetical protein  26.83 
 
 
176 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.395869  hitchhiker  0.00176642 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1880  spermidine acetyltransferase  31 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1834  spermine/spermidine acetyltransferase  31 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2022  spermidine acetyltransferase  31 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1212  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0765  hypothetical protein  26.43 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0916  hypothetical protein  26.43 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0645172  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1138  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3285  putative diamine N-acetyltransferase  32 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2057  putative diamine N-acetyltransferase  31 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2102  spermidine acetyltransferase, putative  33 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2856  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2101  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0948577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2135  putative diamine N-acetyltransferase  32 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2024  putative diamine N-acetyltransferase  32 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2920  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1608  hypothetical protein  24.05 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136851  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3959  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>