20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4496 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4496  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.115903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2303  hypothetical protein  32.18 
 
 		 678 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00124  hypothetical protein  30.43 
 
 		 622 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2083  hypothetical protein  29.61 
 
 		 615 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.999521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1219  hypothetical protein  30.46 
 
 		 693 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0636  hypothetical protein  27.15 
 
 		 759 aa  62.8  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  38.04 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0313  hypothetical protein  32.05 
 
 		 746 aa  61.6  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1399  hypothetical protein  30.77 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0840  histidine triad (HIT) protein  38.04 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  hitchhiker  0.000000646753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  39.76 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0344  histidine triad (HIT) protein  41.98 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448559 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1188  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1022 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0183  hypothetical protein  29.53 
 
 		 853 aa  58.9  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0347623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2116  hypothetical protein  30.53 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.539609  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1016  hypothetical protein  28.67 
 
 		 664 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0987  hypothetical protein  28.67 
 
 		 664 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0168  hypothetical protein  31.33 
 
 		 483 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  26.38 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>