27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1188 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0183  hypothetical protein  100 
 
 		 853 aa  1741    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0347623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1188  hypothetical protein  100 
 
 		 1022 aa  2093    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2303  hypothetical protein  35.41 
 
 		 678 aa  413  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2116  hypothetical protein  46.71 
 
 		 507 aa  402  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.539609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00124  hypothetical protein  34.93 
 
 		 622 aa  371  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2083  hypothetical protein  35.6 
 
 		 615 aa  368  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.999521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2115  Peptidase M15A  53.18 
 
 		 358 aa  346  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.759128  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0313  hypothetical protein  30.7 
 
 		 746 aa  323  8e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0636  hypothetical protein  28.78 
 
 		 759 aa  314  5.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1016  hypothetical protein  29.5 
 
 		 664 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0987  hypothetical protein  29.5 
 
 		 664 aa  298  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1219  hypothetical protein  31.03 
 
 		 693 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1399  hypothetical protein  30.26 
 
 		 487 aa  231  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0168  hypothetical protein  27.29 
 
 		 483 aa  161  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2302  hypothetical protein  52.03 
 
 		 192 aa  157  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2082  hypothetical protein  49.66 
 
 		 196 aa  153  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1220  hypothetical protein  43.48 
 
 		 194 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1223  peptidase M15A  41.18 
 
 		 194 aa  125  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1194  hypothetical protein  41.06 
 
 		 194 aa  124  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2520  hypothetical protein  46.55 
 
 		 160 aa  115  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.400548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00125  hypothetical protein  40.98 
 
 		 229 aa  100  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 284 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 		 289 aa  62.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0840  histidine triad (HIT) protein  31.2 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  hitchhiker  0.000000646753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0344  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4496  hypothetical protein  29.53 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.115903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>