10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2520 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2520  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  333  5.999999999999999e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.400548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2302  hypothetical protein  45.32 
 
 		 192 aa  131  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00125  hypothetical protein  43.54 
 
 		 229 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2082  hypothetical protein  40.69 
 
 		 196 aa  117  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1188  hypothetical protein  46.55 
 
 		 1022 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0183  hypothetical protein  46.55 
 
 		 853 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0347623 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1194  hypothetical protein  42.11 
 
 		 194 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1223  peptidase M15A  42.11 
 
 		 194 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2115  Peptidase M15A  47.32 
 
 		 358 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.759128  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1220  hypothetical protein  41.86 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>