21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1248 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  75.43 
 
 		 232 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  58.01 
 
 		 233 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4598  hypothetical protein  53.59 
 
 		 260 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  33.89 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  31.92 
 
 		 369 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  31.69 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  31.15 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4601  late embryogenesis abundant protein  38.24 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  29.32 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3879  hypothetical protein  28.44 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3871  late embryogenesis abundant protein  28.12 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.396289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5622  nutrient deprivation-induced protein  27.31 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.227691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1245  late embryogenesis abundant protein  34.31 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6818  hypothetical protein  32.56 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  28.51 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  27.17 
 
 		 359 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1436  hypothetical protein  30.72 
 
 		 395 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.050652  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4200  hypothetical protein  27.4 
 
 		 281 aa  48.9  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00749597  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  26.32 
 
 		 329 aa  48.9  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3876  hypothetical protein  33.56 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>