32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1592 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  663    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  36.29 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  32.03 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  32.48 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4598  hypothetical protein  34 
 
 		 260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  32.15 
 
 		 369 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  30.94 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  33.06 
 
 		 233 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  28.57 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  28.23 
 
 		 232 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  31.69 
 
 		 241 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  27.93 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5622  nutrient deprivation-induced protein  41.18 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.227691 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3899  putative nutrient deprivation-induced protein  43.37 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2211  hypothetical protein  28.72 
 
 		 378 aa  67  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3879  hypothetical protein  25.19 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3871  late embryogenesis abundant protein  26.51 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.396289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2258  hypothetical protein  25.87 
 
 		 275 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6819  hypothetical protein  34.07 
 
 		 133 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7554  hypothetical protein  32.94 
 
 		 133 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0154653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1436  hypothetical protein  30.46 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.050652  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4200  hypothetical protein  28.31 
 
 		 281 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00749597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6818  hypothetical protein  32.38 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1245  late embryogenesis abundant protein  28 
 
 		 407 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2072  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.87 
 
 		 170 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4601  late embryogenesis abundant protein  27.72 
 
 		 405 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3559  hypothetical protein  28.16 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3876  hypothetical protein  24.8 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1688  hypothetical protein  25.41 
 
 		 127 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1832  hypothetical protein  29.63 
 
 		 128 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0519  hypothetical protein  34.21 
 
 		 118 aa  43.5  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.256789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1553  hypothetical protein  29.87 
 
 		 128 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>