18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3871 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3871  late embryogenesis abundant protein  100 
 
 		 407 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.396289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1245  late embryogenesis abundant protein  84.77 
 
 		 407 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1436  hypothetical protein  62.35 
 
 		 395 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.050652  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4601  late embryogenesis abundant protein  48.3 
 
 		 405 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3876  hypothetical protein  26.35 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4598  hypothetical protein  31.05 
 
 		 260 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  32.34 
 
 		 233 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  26.97 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  26.4 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  26.4 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  28.12 
 
 		 241 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2258  hypothetical protein  28.27 
 
 		 275 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  27.94 
 
 		 268 aa  50.4  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6818  hypothetical protein  28.83 
 
 		 272 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  25 
 
 		 359 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  26.9 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  21.51 
 
 		 335 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5622  nutrient deprivation-induced protein  22.22 
 
 		 332 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.227691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>