17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4601 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4601  late embryogenesis abundant protein  100 
 
 		 405 aa  774    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3871  late embryogenesis abundant protein  49.27 
 
 		 407 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.396289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1245  late embryogenesis abundant protein  49.76 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1436  hypothetical protein  49.15 
 
 		 395 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.050652  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3876  hypothetical protein  30.77 
 
 		 333 aa  126  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  33.15 
 
 		 241 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  32.43 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4598  hypothetical protein  29.52 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  28.73 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  31.61 
 
 		 369 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  30.46 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6818  hypothetical protein  29.78 
 
 		 272 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  28.36 
 
 		 250 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2072  protein of unknown function DUF883 ElaB  27.42 
 
 		 170 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  30.66 
 
 		 268 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  27.85 
 
 		 359 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  27.93 
 
 		 327 aa  43.5  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>