27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3143 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  500  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  33.01 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  34.48 
 
 		 335 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  29.79 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3899  putative nutrient deprivation-induced protein  50.65 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5622  nutrient deprivation-induced protein  45.12 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.227691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  29.84 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  26.8 
 
 		 369 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  39.19 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  31.41 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  30.63 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  26.88 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2211  hypothetical protein  41.46 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4598  hypothetical protein  26.32 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3879  hypothetical protein  29.17 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6819  hypothetical protein  34.67 
 
 		 133 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7554  hypothetical protein  32 
 
 		 133 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0154653  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2258  hypothetical protein  26.27 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601057  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  26.97 
 
 		 329 aa  52.4  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3876  hypothetical protein  24.48 
 
 		 333 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1688  hypothetical protein  31.17 
 
 		 127 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4601  late embryogenesis abundant protein  31.17 
 
 		 405 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1832  hypothetical protein  29.87 
 
 		 128 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6818  hypothetical protein  26 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1553  hypothetical protein  29.87 
 
 		 128 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666446 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3871  late embryogenesis abundant protein  25.88 
 
 		 407 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.396289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1482  hypothetical protein  35.53 
 
 		 126 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>