24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5259 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  100 
 
 		 335 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5622  nutrient deprivation-induced protein  67.88 
 
 		 332 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.227691 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3899  putative nutrient deprivation-induced protein  50.78 
 
 		 321 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  28.66 
 
 		 268 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  32.03 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  30.29 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  30.62 
 
 		 369 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  34.48 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  26.61 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4598  hypothetical protein  29.02 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  29.25 
 
 		 232 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6819  hypothetical protein  37.97 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7554  hypothetical protein  35.44 
 
 		 133 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0154653  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  28.51 
 
 		 241 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2211  hypothetical protein  27.95 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  25.31 
 
 		 233 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  23.27 
 
 		 329 aa  52.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1688  hypothetical protein  36.47 
 
 		 127 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1832  hypothetical protein  36.11 
 
 		 128 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.494207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1553  hypothetical protein  36.62 
 
 		 128 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.666446 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4200  hypothetical protein  41.05 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00749597  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1482  hypothetical protein  36.36 
 
 		 126 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263136 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3879  hypothetical protein  37.23 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3871  late embryogenesis abundant protein  20.88 
 
 		 407 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.396289  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>