9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1436 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1436  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  773    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.050652  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3871  late embryogenesis abundant protein  62.35 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.396289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1245  late embryogenesis abundant protein  63.81 
 
 		 407 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4601  late embryogenesis abundant protein  48.44 
 
 		 405 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3876  hypothetical protein  38.51 
 
 		 333 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  34.12 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  30.12 
 
 		 241 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  28.33 
 
 		 233 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  30.46 
 
 		 327 aa  43.5  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>