More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0841 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0841  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
326 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2154  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
326 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.110451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2915  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.58 
 
 
320 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3309  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.27 
 
 
320 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3686  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.3 
 
 
309 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1548  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.3 
 
 
309 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3125  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.58 
 
 
320 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618983  unclonable  0.000014067 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2558  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  37.96 
 
 
320 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1084  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.54 
 
 
312 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0840793  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.54 
 
 
312 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2936  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.54 
 
 
312 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2164  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.54 
 
 
312 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0243723 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0925  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  37.96 
 
 
320 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94053  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.54 
 
 
312 aa  176  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.778833  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2924  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.54 
 
 
312 aa  176  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.690618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.99 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.99 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0519  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.2 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.2 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.2 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.2 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.909049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.2 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206363  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4601  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.2 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.22 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573271  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2843  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1041  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3803  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  39.2 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1511  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  39.2 
 
 
320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0532296 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0072  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  39.2 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413963  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2280  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
320 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0045  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  35.2 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0046  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  35.2 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0094  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  35.2 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.05206  hitchhiker  0.00363531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0132  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  35.2 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0760311  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0488  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  35.2 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0670  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  35.2 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.375238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0723  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  35.2 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0958  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  35.2 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1143  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  35.2 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1718  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  35.2 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00396754  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2073  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  35.2 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000159022  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2810  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  35.2 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2975  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  35.2 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3429  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  35.2 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5211  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.73 
 
 
319 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313194  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.12 
 
 
316 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0987071  normal  0.815394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0619  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.58 
 
 
320 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0564215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1204  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.58 
 
 
320 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.89173  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4514  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
320 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.654029  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4455  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
320 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.33 
 
 
314 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.33 
 
 
314 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.934881 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0821  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
320 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3255  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
320 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  hitchhiker  0.00658118 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.02 
 
 
314 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2920  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.72 
 
 
320 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1046  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  36.31 
 
 
316 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1261  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  36.31 
 
 
316 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1426  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  36.31 
 
 
316 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0372411  normal  0.895779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2597  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  36.31 
 
 
316 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3883  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  36.31 
 
 
316 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4991  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  36.31 
 
 
316 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1602  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.02 
 
 
314 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2900  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.58 
 
 
320 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0388  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.15 
 
 
318 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2289  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.15 
 
 
318 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.795414  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3496  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.15 
 
 
318 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.118492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3708  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.73 
 
 
319 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0788  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.58 
 
 
320 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2833  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.58 
 
 
320 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000442948  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0870  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.58 
 
 
320 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3882  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.58 
 
 
320 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1134  transposase IS116/IS110/IS902  35.2 
 
 
323 aa  169  7e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3633  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.27 
 
 
320 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0777  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.58 
 
 
320 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341483  normal  0.825229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3874  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.58 
 
 
320 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4589  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.58 
 
 
320 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0856  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.54 
 
 
318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0433  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.58 
 
 
320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0840  transposase IS116/IS110/IS902  33.33 
 
 
318 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0862  transposase IS116/IS110/IS902  33.33 
 
 
318 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.595658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1845  transposase IS116/IS110/IS902  33.33 
 
 
318 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1950  transposase IS116/IS110/IS902  33.33 
 
 
318 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0873071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2653  transposase IS116/IS110/IS902  33.33 
 
 
318 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3756  transposase IS116/IS110/IS902  33.33 
 
 
318 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.723193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3703  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.27 
 
 
320 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1531  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.27 
 
 
320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1737  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.27 
 
 
320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183684  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1326  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.27 
 
 
320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0664972  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1179  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.62 
 
 
315 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7866  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.62 
 
 
315 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8696  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.62 
 
 
315 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5832  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.62 
 
 
315 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4794  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.62 
 
 
315 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4517  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.27 
 
 
320 aa  165  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000931512  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2941  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.27 
 
 
320 aa  165  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2281  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.27 
 
 
320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1627  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  37.96 
 
 
320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1643  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  37.96 
 
 
320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0154  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  38.27 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0704201  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>