11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5027 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5027  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1626  hypothetical protein  58.82 
 
 		 68 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0038  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229986  hitchhiker  0.0000929827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2959  hypothetical protein  55.36 
 
 		 68 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3356  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3851  hypothetical protein  47.92 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00188624  normal  0.510213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3386  hypothetical protein  45.83 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4094  hypothetical protein  45.83 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2911  hypothetical protein  51.22 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0037  hypothetical protein  35.94 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254213  decreased coverage  0.0000236921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5018  hypothetical protein  38.71 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>