12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1626 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1626  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2959  hypothetical protein  64.71 
 
 		 68 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0038  hypothetical protein  68.85 
 
 		 68 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229986  hitchhiker  0.0000929827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5027  hypothetical protein  58.82 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3386  hypothetical protein  56.36 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3356  hypothetical protein  60.38 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4094  hypothetical protein  56.6 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3851  hypothetical protein  56.6 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00188624  normal  0.510213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0037  hypothetical protein  48.21 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254213  decreased coverage  0.0000236921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2911  hypothetical protein  60 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5018  hypothetical protein  41.07 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2910  hypothetical protein  62.5 
 
 		 36 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>