13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3851 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3851  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00188624  normal  0.510213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3356  hypothetical protein  89.19 
 
 		 74 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4094  hypothetical protein  87.84 
 
 		 74 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3386  hypothetical protein  83.78 
 
 		 74 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5018  hypothetical protein  64.91 
 
 		 69 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0037  hypothetical protein  61.4 
 
 		 74 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254213  decreased coverage  0.0000236921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2959  hypothetical protein  58.7 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1626  hypothetical protein  56.6 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2960  hypothetical protein  52.83 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0038  hypothetical protein  51.02 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229986  hitchhiker  0.0000929827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3368  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5027  hypothetical protein  47.92 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2911  hypothetical protein  46.34 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>