11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5018 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5018  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3851  hypothetical protein  64.91 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00188624  normal  0.510213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0037  hypothetical protein  59.68 
 
 		 74 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254213  decreased coverage  0.0000236921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3356  hypothetical protein  61.4 
 
 		 74 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3386  hypothetical protein  59.65 
 
 		 74 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4094  hypothetical protein  59.65 
 
 		 74 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2960  hypothetical protein  49.25 
 
 		 80 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2959  hypothetical protein  42.31 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1626  hypothetical protein  41.07 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5027  hypothetical protein  38.71 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2910  hypothetical protein  57.14 
 
 		 36 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>